柯南是小孩子不能深潛,但是有其他深潛的人直接將下潛看到的情景直播，也算讓沒有機會深潛的孩子們跟不喜歡潛水的成年人能了解海下的情況。
柯南很敏銳的觀察到這附近有海溝，這地方比他們所想象的更深。
“可以讓潛水員上來,我們換一個地方潛水嗎？”柯南詢問工作人員,“這裡比較危險。”
工作人員沒當回事：“小朋友，不要搗亂。”
明明成年了,卻被當小孩子對待不允許下水的亂步先生抱著胳膊正生悶氣,聽這邊說話，不緊不慢的插了一嘴。
“是因為海溝啦海溝，無論是深潛還是浮潛，都要避開一些，海溝附近的洋流會將人帶遠,很可能自己無法回來。”
柯南補充：“沒錯，如果說船隻在這裡遭遇了事故沉入深海還可以理解，但是幽靈船不是出現過好幾次嗎？也就是說船隻出事的原因多半與之前曾有人觀察到的船上‘內訌’痕跡有關，海溝之中應該沒有我們要找的線索，請讓水下的人立即回來。”
有兩人都這麼說,哪怕是小孩子,工作人員也有些尷尬了。這時候與謝野晶子走過去跟工作人員溝通了下，最終工作人員還是同意了，去找負責人商量了一下，讓大家上了船，直接前往下一個地點。
還好大家都挺服從分配的，很快上了船。中間還有一段小插曲,有鯊魚在附近行動，柯南二話沒說拿出滑板，滑板變成汽艇模式帶他水上疾走,見速度不夠快，還彈出一個足球一腳過去，足球砸暈鯊魚，柯南迅速救人上船。
船員：“那，那是什麼！”
安室透乾笑：“哈，島國科技，島國黑科技。”
風波過後，繼續前進，想不到沿途竟然看到了有鯨魚在噴水！眾人興致勃勃，能近距離觀察鯨魚的機會很少，這次也算歪打正著。
柯南也有點激動：“是水柱！應該是須鯨類，離得太遠，還看不太清具體是什麼品種。”
亂步先生也很感興趣：“是露脊鯨，他們的活動範圍離陸地較近，經常被捕鯨船盯上所以瀕臨滅絕，北太平洋僅有1000隻，北大西洋也僅有100隻，有著巡遊特性。鯨魚出現在這附近……啊，是那樣子嗎，還真是不可避免的衝突與悲劇。”
柯南也想到了什麼，擰眉沉思之後，看向亂步先生。
……不管名字是不是假的，這名偵探，的確有點本事。
灰原哀忍不住小聲詢問柯南：“怎麼回事，柯南？”
柯南也小聲回答：“鯨魚，聲呐，我這麼說你應該明白了吧？”
若說彆的，灰原哀或許不太了解，但跟生物有關的事她反應極為敏銳。
小哀：“你的意思是，軍用聲呐？”
聲呐是船隻使用的探測裝置，一般對鯨魚的影響不大。但是海軍用來監測潛水艇的聲呐，不僅聲源處的分貝高，傳播也比較遠。其中的低頻聲呐傳播可達數千公裡，其頻率跟大型鯨魚交流信號頻率相似。尤其是在遷徙或巡遊之中的鯨魚很容易受到乾擾，迷失正確的方向。
柯南道：“因為中頻跟高頻聲呐，會對海洋生物尤其鯨魚的鼓膜造成破壞乃至致死，因此很多國家的軍方采用低頻聲呐。但即便如此，對海洋哺乳類的影響也極為惡劣。”
小哀接話：“但是也有相關法律規定，如果附近有海洋哺乳類，必須立即關閉聲呐。”
柯南道：“那是遵從法律的軍方，如果是用其他途徑弄到了聲呐，想要探索海溝附近情報的私人團體，在鯨魚活動的範圍沒有關閉聲呐？”
小哀沉下來臉：“恐怕這就是內訌的真正原因。”
並不是為了寶藏，而是對於是否關閉聲呐，停止對此領域的探索。
露脊鯨又是瀕臨滅絕的保護物種，在它們活動的海域使用聲呐來探索海溝，是絕對禁止的項目。
當有著無論如何都想探索這條海溝的人，與發現附近有珍貴瀕臨滅絕的鯨魚，全力阻止不想讓聲呐開啟的人，兩者之間的衝突造成了悲劇。
柯南輕咳一聲：“當然，這隻是猜測，所有的情報都是不夠客觀的二手消息，沒有實際看到幽靈船之前還難以斷定。讓人感到好奇的是，這條海溝到底有著怎樣的秘密，讓人不惜做到此種地步都要用聲呐來探索？”