作為《生化危機》劇情世界上最強大的商業帝國，保護傘的子公司遍布世界各地，有著極其龐大的規模和錯綜複雜的體係，公開資料顯示，由三個主要部門負責管理，分彆是：紅傘公司，白傘公司和藍傘公司。
這三個部門分工明確，各司其職，效率很高，必要的時候“三色傘”也會相互合作，共克難關。
紅傘公司（RedUmbrella）是保護傘內部的準軍事化部門，擁有大量的安保人員和準軍事人員，同時也是計算機研發和資料管理部門，其主要的研發成果就是設計出了頂級人工智能“紅後”。
白傘公司（WhiteUmbrella）是保護傘內部的生物研究部門，主要負責與B.O.W（有機生物兵器（Bianicon）的縮寫，由保護傘公司在浣熊市所培育出來，培養源是T病毒）相關的研究工作，是保護傘公司最重要的一個部門。
除了研究病毒，白色傘還擁有自己的情報機構和強大的間諜網絡，其間諜人員會滲透到競爭公司和各個政府機構中竊取情報，並順手清理那些可能損害公司利益的人。
藍傘公司（BlueUmbrella）是保護傘內部的B.O.W研發部門，主要負責B.O.W相關的藥物與試劑的研究，那各式各樣的病毒培養液，均出自藍傘公司。當然，在絕大多數情況下，藍傘都會與白傘進行合作。
保護傘公司在世界各地都擁有自己的資產，數量之多，難以統計，尤其是很多固定資產，其建築規模和用途及保密程度都已達到軍事級彆：
《生化危機1：變種生還》中的浣熊市地下蜂巢，位於浣熊市地下百米深的地方，是保護傘內部保密程度很高的研究所，主要負責T病毒的研發，擁有數百名工作人員和安保人員，在建築內部還有很多安全走廊，裡麵放置著大量殺傷力很強的防禦武器，如鐳射激光陣等。
《生化危機2：懲罰》中的浣熊市市立醫院，是保護傘公司在浣熊市設立的私人醫院，規模不小，樓頂還設有停機坪，醫院內部還有獨立的實驗室，可進行改造實驗。第一部中的馬特被抓走後，就被帶到這裡，最終淪為“複仇女神計劃”的犧牲品。
《生化危機3：滅絕》中的末世大本營的科學部門，這個科學部門位於內華達州的沙漠下方，也是類似蜂巢一般的建築，隻不過這裡不光研究T病毒，還研究如何控製喪屍。建築內部，機關重重，一步踏錯就會命喪黃泉，很多愛麗絲的克隆體就是在走廊內尋找出路時，被機關殺死。這裡被愛麗絲本體攻占後，解放了所有克隆體，並組建了一支“愛麗絲克隆人軍團”，在世界各地與保護傘公司對抗。
《生化危機4：戰神再生》中的保護傘（亞洲）總部，總部位於日本東京，也是一座地下蜂巢式建築，從結構圖上看大小應該和其它蜂巢一樣，不過內部沒有過多的實驗室和研究單位，而是駐守了大量的精銳士兵和武器裝備。另外還有一艘“阿卡迪亞號”實驗貨船，這是保護傘公司設在海上的移動堡壘，其內部有先進的生化實驗室，可進行生物實驗，還存放了大量的步兵戰車和V22運輸機。用於抓捕和運輸幸存者進行活體實驗。
《生化危機5：懲罰》中的海底實驗場，海底實驗場位於北極圈境內，是前蘇聯時期建造的海底基地，其內部空間十分巨大，不僅存放著數量眾多的潛艇，還模擬了許多城市，甚至有一座規模巨大的克隆人工廠，晝夜不停的生產克隆人。克隆人無一例外都是《生化危機》曆代記出現的主角團成員。注射各種T病毒變體以及生化寄生蟲後，主角團克隆人會突變成強大的B.O.W有機生物兵器。最後的決戰就在為自己注射了普拉卡寄生蟲（LasPlagas）的萊恩克隆體之間展開。