有了銀子後，閻應元曾要求留下部分銀子改善百姓住宿和生活，把絕大部分銀子送往京師，但被朱慈烺拒絕。
朱慈烺並不缺銀子，三十來萬兩銀子對他來說根本不算什麼，他要求閻應元把銀子用在昌平軍隊訓練和城防建設以及百姓生活上。
當初留下閻應元，朱慈烺就是想把昌平打造成一個與眾不同的城市，以後昌平就是大明其他城市建設的模版。
朱慈烺奢求昌平變成後世那樣繁榮，隻要城市整潔衛生，百姓安居樂業，軍隊訓練有素，人人都能吃飽飯就行。
閻應元確實也是按照朱慈烺設想那樣建設昌平的，他首先改建百姓住房，原來被燒毀的房子全部推倒重建。
新建的房子都是一層青磚瓦房，失去房屋的百姓一家可以分到兩間房，並且還建造大量廁所，任何人不允許隨地大小便，如果隨地大小便，被發現後一天不給飯吃。
彆看一家隻有兩間房，即使一家五口人，也不要擔心住不下，一家人擠擠足夠住，總比他們以前的房子好，並且是免費提供。
房子很簡單，遠沒有後世瓦房寬大，高度也不及後世磚房，建房子總共用了兩萬多兩銀子，都是材料費用。
為百姓建房子大夥都非常高興，乾活也很踴躍，所以不用付一文工錢，隻要給飯吃就行。
在建房子之前，閻應元就已經在人多的地方建造多個食堂，一天兩頓飯全部免費，直到來年有收成為止，畢竟百姓都已經分到田地。
免費飯食一天兩頓，乾活時中午米飯和饅頭，下午是米粥，並有一些葷菜。
不乾活時，依然和之前一樣，一天兩頓稠粥，中午和晚上，早上不提供飯食。
為了便於管理，閻應元把二十家編為一組，選出一家人多的做有償組長，他們負責管理這二十家的衛生問題，並對每家來的陌生人進行登記上上報。
如果在戰時，一家出問題，這二十家都要負責，這樣能讓二十家百姓在戰時相互監督。
步入正軌後，閻應元傳令，全城百姓商賈地主大戶（老實交出多餘田地沒有動他們）十二歲以上和五十歲以下無論男女上午全部參加訓練。
訓練內容先是跑步，然後練習配合士兵守城，主要負責搬運滾木礌石等。
另外還要訓練他們運送受傷將士下城養傷，為將士們做飯送飯，在敵人沒有攻城之時，替將士們放風守城換將士們休息。
閻應元的最終目的，就是在戰時整個昌平能夠做到全民皆兵共同對抗外敵入侵。
曆史上江陰八十一日時，抗清三公也是如此做的，不然絕對做不到如此驚天地泣鬼神的英雄壯舉。
招募的六千新兵也被閻應元分成戰兵和治安巡邏隊，一千治安巡邏隊在和平時期主要負責城裡治安和城裡城外巡邏，戰時上城防守。
五千戰兵裡有一支百人夜不收，他們分散在昌平周邊活動，對昌平二十裡以內的情況要做到了如指掌，一旦有外敵入侵要及時發出預警信號。
看到信號後，昌平全城四門緊閉，要迅速進入臨戰狀態。
而戰兵在張書廷的率領下一直堅持刻苦訓練，不但要訓練射擊和陣列，還要訓練騎術，要能在馬上熟練開槍射擊。
閻應元對炮兵要求同樣很高，要求每個炮兵都要熟練使用紅衣大炮和佛郎機炮……
昌平全城百姓對閻大人都很尊敬，隻要閻應元一聲令下，全城迅速出動。
比如修建昌平城裡馬路，全城大大小小隻要會走路的都想幫忙，他們不要工錢，全部自願主動免費建設昌平。
崇禎十年正月初八，昌平城外十裡出現一隊人馬，看人數在百人左右，在這隊騎兵中間還有一駕馬車，正向昌平城快速前進。
在這隊人馬不遠處始終有兩個騎馬的百姓跟隨，這二人正是昌平的夜不收。