第二年正月，在代善等人明智選擇下，皇太極正式廢除“與三大貝勒俱南坐受”，改為自己“南麵獨坐”。
由此，皇太極才成為能夠全麵支配八旗各主的權威人物。
雖然二人均十分努力，但崇禎的成效卻大打折扣。相反，皇太極不斷穩固權威後，將滿洲進一步推向新的高度。
崇禎與皇太極都是明朝末年較有作為的皇帝，但是他們在用人和軍政謀略上卻有著根本的不同。
急躁的性格和麵對大明官僚機器整體素質下沉的情況下，他對文武官員越來越缺乏信任。
崇禎認為，內臣都不堪使用，不得已大量啟用宦官，對於使用宦官內臣，崇禎也說出了不得已的苦衷：
“文武各官，朕未嘗不信用，誰打起精神實心做事？隻一味朦徇諉飾，不得已差內臣查核，原出一時權宜，若是差來不行，差他做什麼？你們外臣果有肯做事，朕何必要用內臣。”
當時對於皇帝使用宦官的危害，已經有了較為係統的總結：
“宦官內侍之流，若用為耳目，即耳目蔽，用為心腹，即心腹病。馭之之道，在使之畏法，不可使有功，畏法則檢束，有功則驕恣。”
此外雖然能夠不拘一格選人用人，然而17年裡，卻是庸才遍地，以當時最重要的閣臣為例，總共五十人。
其中周延儒、溫體仁為首輔最久，可周廷儒實庸篤無材略，且性貪，另外的溫體仁專務刻核，迎合帝意，且在其任內，未聞其進一善言，未聞其行一善政。
要命的是，負責明朝軍事的總督、巡撫、總兵、副總兵大多不懂軍事，鮮有能帶兵之人，尤其在毛文龍和袁崇煥死後，當時整個大明已經沒有真正的大將。
如王洽在擔任兵部尚書後，以至於到了不習邊事，聞驚倉惶無以應。
相反皇太極在使人用人上更為從容，首先其父給他留下了重要的四梁八柱的幾大貝勒和子侄們。
皇太極在崇禎四年，戰役中俘獲了祖大壽的兩個兒子和一個侄子，他故伎重演，給他們最好優待，並以此招降祖大壽。
第一次祖大壽熬住了，第二年皇太極再次圍困城中斷糧的祖大壽，這次與祖大壽城下之盟。
為了表示對祖大壽的充分信任，讓他做先鋒帶兵攻打錦州，在錦州城下，祖大壽甩開大隊人馬逃入城中。
此時皇太極招降的戰略高度和眼光再次表現出來，他親自好安慰與祖大壽一起投降的降將，並給祖大壽的兒子們賜予宅院，將祖大壽與他們區彆開來。
雖然此後曆經了漫長的七年才再次俘獲祖大壽，這一次，祖大壽以為不免一死，出乎意料，皇太極依然對其誠懇勸慰，最終祖大壽被徹底征服。
曆史證明，如果沒有後來越來越多，位置越來越重要的漢人歸降，滿洲人奪取天下根本無法實現。
這就是為什麼，當初努爾哈赤厚待李永芳的主要原因，招降的不隻是一個李永芳，而是比李永芳十倍重要的手中握有重權的大明高級將領。
儘管那時沒有具體目標，到了皇太極這時，對於招降的整體戰略部署越來越清晰具體。
明崇禎十五年，這年三月，明朝和滿洲之間發生了一次關鍵性戰役——鬆錦州之戰。
作為戰略要地的錦州，洪承疇是最高駐防將領被俘後，也曾想以死殉國，但對自己下不了手，他在監獄裡日夜痛罵，拒絕飲食。
皇太極對此早有準備，耐心思想說服工作，給他精美衣食待遇，甚至不惜讓大玉兒和洪承疇發生某些聯係。
他還時不時還要去監獄中親自探望，當看到洪承疇衣服單薄時，脫下自己的貂裘大氅給他披上，並且溫和問道：
“先生得無寒乎？”
這句“暖心”的話，讓洪承疇直直地望著皇太極很久，感歎說：
“真命世之主也！”乃扣頭請降。
崇禎十五年九月，鬆錦決戰剛結束，滿洲官員一起向皇太極上奏，建議趁此機會，迅速全麵發兵直取燕京，控扼山海關，大業克成。
對於如此急躁的急功近利，皇太極表現出了高度的軍事戰略眼光，他批示說：
“爾等建議，直取燕京，朕意以為不可。”
緊接著他把大明比成粗壯大樹：
“無論有多大氣力，有多著急，絕不會一斧子就把大樹砍倒，而是從大樹兩旁一斧斧地砍下去，到了一定程度，這棵大樹自然自己倒下。
可憐皇太極都沒有想到，讓大明這棵風雨飄搖的樹轟然倒下的，並不是是關外的皇太極，而是李自成與其不約而同的一齊發力。
也不怪崇禎在國破前夕在書桌上寫下“文臣人人可殺”的數個大字。
直到自戕之前，李自成竟然出奇的要給他一條生路“議割西北一帶，分國而王，並犒賞軍銀百萬兩。”
並承諾可以為大明打退各地賊寇，包括對付滿洲的皇太極。
崇禎問魏藻德：
“此議何如？今事已急，可一言決之。”
老奸巨猾的魏藻德擔心承擔負責，始終一言不發，氣得崇禎推倒龍椅，匆匆離去。
無論皇太極多麼厲害，但他也未能看到大明這棵樹轟然倒塌，就猝然去世。
巧合的是，崇禎僅僅在幾個月後，也拖著疲憊的身子徹底為大明獻身，這種驚人巧合令後人喟歎不已。
率軍進入錦州後，朱慈烺和崇禎太上皇住在總兵府。
此時崇禎還不知道祖大壽已經戰死，由於不想和祖大壽見麵，崇禎特意交代朱慈烺：
“皇兒，祖大壽拜見時，你先讓王大伴通知父皇，父皇不想見他……”
曆史上崇禎殺了袁崇煥後，幾次召見祖大壽，祖大壽心虛都找借口躲避，讓崇禎很是不爽，可為了讓祖大壽繼續鎮守遼東，崇禎一直不敢動他。
現在威名赫赫的小殺星率領護國軍來到錦州，崇禎知道祖大壽絕對不敢躲避，不然朱慈烺必殺他。
崇禎已經退位，朱慈烺殺不殺祖大壽，崇禎不會去乾涉，但祖大壽想見他崇禎太上皇絕不可能，麵子不要嗎？
朱慈烺當然知道崇禎太上皇心裡想法，他輕輕歎口氣道：
“父皇，過去就算了，您就算想見祖大壽，現在已經見不到，祖大壽已經戰死……”