等到複仇者號經過幾年的發展，加入了大量科研人員，戰士和經受考驗的誌願者後，複仇者逐漸成長到反抗者高層期望的目標——一個具有超強隱身能力，良好聯絡能力的空中行動平台。
為了做到這一點，各國再次把精英和最新技術彙聚一處，把這艘飛船裡外翻新了一遍。不僅在它的表麵采用了熱量屏蔽技術, 還加裝了先進的光譜隱身材料，這樣一來，複仇者號在雷達屏幕上的反饋麵積就隻有一隻烏鴉那麼大。
隨後飛船的內部被打造成了X現在的行動基地，不過現在處於運行狀態的艙室是研發部，工程部，司令部和軍械部和X的看家本領——靈能實驗室。
而飛船依舊還有70%的空間在等待更多的擴建計劃。
靈能實驗室分為兩個工作組：造物組和行為組，行為組秉承自X前代的GEIST項目, 負責發掘有潛力的人類靈能戰士。而造物組則專注於打造能夠發現靈能, 捕捉靈能甚至利用靈能的工具。
靈能實驗室的負責人是馬林博士，這也是曾經位於法棱博士之下的老員工，也是GEIST項目的親曆者之一。讓老資曆者安排成為這個項目的主管，也是讓沈，法棱和約翰放心的。
工程部的領袖是剛剛滿18歲的莉莉?沈……不要誤會，老沈可沒有死，但是他也選擇了成為顧問而不再擔任實際職務了。
莉莉雖然很年輕的樣子，但是其工程維修的手段和超強的網絡駭客技術還是非常出色的。而且她還以完成一項超級工程而大功傍身，再毫無爭議的輿論下成為了主管。
研究所位於飛船的動力核心周圍，作為一個重要的部門，它跟處於貨船頭部的核心比起來，有點像摩托車跟路虎一樣的體積比例。
研發部的主管也換了一位新人，理查德?泰根，一位黑人博士成為了複仇者號上的研發部新主管，不過目前他還在適應著工作中。
泰根其實算個徹頭徹尾的外人，他不但之前沒有在X裡工作過，甚至還是從變種人臭名昭著的基因診所裡跳槽過來的。
不過泰根在戰前確實是個聲名在外的科學家，在芝加哥大學和三叉戟製藥公司裡都占有一席之地, 他在器官移植用的免疫抑製類藥物領域取得的研究成果可謂前無古人。而如同大多數知名科學家一樣, 在變種人政府要求他合作時，他也的確沒什麼選擇的餘地。
但這家夥也是一個難以想象的狠人。每個給變種人工作的職員，都必須要在後腦微創植入一份芯片——但跟監控變種人心智是否異常的功能不一樣的是，這裡隻是考驗忠誠性質的芯片。
但在最後發現了變種人目的不純，而且自己還被迫製造了大屠殺以後，受不了的泰根博士暗中聯係了地下反抗軍，而且還自己給自己做芯片移除手術！
自己給自己的後腦做芯片移除手術啊！！！
等到約翰?布萊德福德和自己感到了他的地下秘密研究所時，他人快要不行了，還是謝元幫助他做完了手術的最後部分——用醫療膠封的口。
雖然大體上，拯救泰根博士的那次行動，不過是一次變種人為了埋伏出勤小隊而設置的埋伏，但結果還是算皆大歡喜的。
而自從這次行動後，泰根博士再被觀察了一段時間後，就被沈博士舉薦並安排成為了現在研究部門裡的主管，雖然隻是暫時一個人的主管。
上任第一天，他的研究項目就轉向了救他命的醫療膠這個研究項目上，不過隻能是非主流研究項目……針對外星人單位的解剖和外星人科技的解析才是泰根博士的主要研究項目。
至於法棱博士嘛……她MIA了。
呃……倒不是真的MIA，隻是如果不按MIA處理，她可能要馬上被羈押到軍事法庭，或者反投靠到變種人的勢力去。
事情是這樣的，在沈博士拉著法棱博士過來做顧問協助研究的第二年，變種人軍隊就突襲了X在南極的研究據點。
這是有備而來的偷襲，除了法棱博士僅以身免，所有留在研究基地的人人都被抓回或者被當場處決了。