一百萬多萬兩白銀看似數目巨大，但對海軍建設其實並不多。廖泥鰍之前提出了要將海軍擴充為二萬人，大小火炮戰船要達到兩百艘，但一算成本帳卻焉了頭。實際上不管購買還是自建，戰船本身並不貴，中型戰船不過數千兩銀子，大型戰船也不過值萬餘兩，最大型的三重樓船也不會超出五萬兩白銀。真正昂貴的是戰船上的火炮。就拿一艘裝備二十門炮的中型戰船來說，一門炮便需要銅料三百斤價值三十兩白銀，製造成本是銅料三倍左右，故一門炮加上必要的彈藥便一百五十兩白銀，二十門炮便是三千兩，再加上船體造價兩千兩，一艘中型火炮戰船便要五千兩白銀。由於大型戰船的所用的火炮更大數量也更多，故造價更是中型火炮戰船的三至四倍。實際上，這還是因為流求島上有豐富的銅礦，也不缺優質木材和鐵，如果材料外購，成本還會翻上幾倍。
反複核算之後，流求公司決定成立一支主力艦隊和二支分艦隊，分彆駐守在台北、台南和小流求。主力艦隊有十艘大型戰艦、二十艘中型戰艦和四十艘小型戰艦，分艦隊戰船數量減半。按大型戰艦一萬五千兩白銀一艘，二十艘計三十萬白銀；中型戰艦五千兩一艘，六十艘計三十萬白銀；小型戰艦二千兩一艘，一百二十艘計二十四萬白銀，僅主力戰船便要花費八十四萬兩。如果再加上火戰船、偵察船、爆破船、運輸船等船隻，這一百多萬兩白銀不僅不算多，反倒顯得略有不足。在人數方麵，每艘大型戰艦一百五十人，中型戰艦八十人，小型戰艦三十人，總兵力達到了一萬零二百人，如果加上輔助船隻的水手人數，兵力達一萬二千人。
當下流求海軍實力僅堪堪達到上述規模的四分之一，雖然有了資金保障，但要建設一支上萬人的海軍絕非易事，仍需要較長時間才能實現。海軍艦隊建設需要“船隻、船員、火炮”這三大要件。與川西霹靂軍擴軍中主要缺火炮不同，流求海軍當下最缺的並不是火炮，而是戰船和有經驗的水手。餘柱從川西帶來的技術人員早就掌握了銅炮製造技術，流求的銅礦開采出來之後，他們又根據本地銅料的情況進行了配比調整和生產工藝優化。由於銅優良延展性和導熱性，流求生產火炮隻需要采用工藝簡單的鑄造法，而不需要川西霹靂軍鐵炮所采用的鏜銑法工藝，生產出來的銅炮不僅重量輕而且性能也夠用，更重要的是所花費工時短了許多。眼下流求銅料足夠，隻需進行精煉之後，便可大批量生產出艦用火炮。
海軍的主戰武器是船隻，而船隻的建造並非一朝一夕之事。一艘戰船從選材、伐木、晾曬再到建造舾裝、試航短則一年至兩年，長則三至四年。如果有了已晾曬好的木料，也需要半年到一年的時間才能造出來。流求不管是當前的現實需要還是遠期的威脅，都等不起這麼長的時間，故餘柱決定一方麵派人收購造船木料，加大自行造船的力度，與此同時又派人多方重金購買船隻進行改裝，甚至還通過賄賂手段購買了沿海製置司水軍的戰船。“重賞之下必有勇夫”，隻要價格給得足夠高，水軍那些官員敢冒著殺頭的風險賣戰船。這些買回來的戰船在船塢進行改裝之後，沒有人會認出曾是官軍戰船。經過一番努力，流求購買改裝了十餘艘大中型船隻和數十隻小型船隻，雖然仍未達廖泥鰍的預期，卻也解決了當下的燃眉之急。