在原作的第一部快要完結時，主角團們會知道一個，對於他們來說極其殘酷的，有關整個世界的真相。
從來就沒有所謂的寬恕和原諒，人類始終是赤與藍之神的棄民，蓋亞教廷對當年所述的一切全是謊言。
七賢者的死因並不是自裁謝罪，實際上他們從未向神靈屈服過，如今的人世間都是他們奮戰的結果。
所謂的神造之神赫爾梅斯，實際上是一種類似高達機甲的巨型構物，由黑白使徒作為其核心操控它進行滅世。
在當年那場千年滅世之中，負責操控赫爾梅斯的白翼使徒伊麗絲，在關鍵時刻被七賢者之首伊紮克成功策反。
他們聯合起來襲擊了黑翼使徒伊邪麗絲，雖然沒有將她徹底消滅，但也成功斬斷半邊翅膀，導致黑翼使徒隕落。
隨著白翼使徒被策反，並導致了黑翼使徒的隕落，神造之神赫爾梅斯終於停止，赤與藍之神授意的滅世也無果而終。
之後七賢者與白翼使徒繼續聯合，讓白翼使徒伊麗絲假扮為現世神蓋亞，編造了如今蓋亞教廷的宣傳口徑。
但他們確實終止了假學的傳播，因為說到底使徒並不是主人，無法真正的操控神造之神赫爾梅斯。
如果讓假學繼續在世界傳播，黑霧汙染的麵積持續不斷擴大，那麼就會有新的黑白使徒誕生，操控赫爾梅斯完成那未完成的滅世。
所以七賢者主導成立的蓋亞教廷，才以一種一刀切的方式，將舊日假學的一切給儘數埋葬。
還在蓋亞教廷之上成立秘密的內院，他們清楚千年滅世時發生的許多真相，職責就是在七賢者都不在以後，繼續領導這個世界埋葬假學。
白翼使徒伊麗絲的壽命並非無限，當她死後由提前培養的複製人，繼續扮演現世神蓋亞的角色，於是真相就這麼被一代代的隱瞞與傳遞下去。
然而等到係列的第二部時，新一批主角團們才會在不斷的冒險中，知道了真相背後的真相。
赤與藍之神並非是世界的創造者，他們是從外星降臨而來的侵略者，這個世界真正的神靈是所謂“綠之神”。
綠之神作為土著神靈，根本無法擊敗能夠星際旅行的赤與藍之神，於是縮到了世界最深處苟延殘喘。
但他終究是這個世界的本源意識，權柄並沒有被徹底剝奪，所以依舊能夠通過另一種形式，不斷影響被赤與藍之神掌控的外界。
比如黑霧在正常情況下，是不會造成前文提到的那種影響，隻是一種正常的汙染現象而已。
之所以這個世界中會導致自然枯萎，被黑霧感染的動植物，對人類——確切地說是赤與藍之民——有著極強的憎恨，這都是源自綠之神的影響。
但綠之神的真正殺招在於“千年之獸”，原作中關於千年之獸的信息並不多，所以不少是戴文瓘的推測。
雖然說千年之獸的誕生和黑霧有關，但千年之獸和假學之間應該不是強關聯，真正孕育他的是文明程度而非假學本身。
千年之獸應該是一種因文明到達一定程度，就會誕生出來毀滅世界的存在，隻不過七賢者這一次輪回體現為假學。
因為在他們成功停擺赫爾梅斯，將假學給徹底埋葬以後，並不能完全阻止千年之獸的誕生。