朱元璋明白胡惟庸的意思，但身為帝王，冰冷無情。
當胡惟庸被抓入地牢之後，塗節再也看不到出去的希望，當即交代了胡惟庸結黨謀逆之事。於是，毛驤從武英殿中離開後，當即封了胡相府，逮捕胡惟庸家眷。
讓毛驤意外的是，胡惟庸之子胡念渠竟然不在府中，詢問之下，才知此人出了城，還以為潛逃了，急忙命人追索，結果沒過多久就傳來消息：
胡念渠擅闖格物學院被抓。
當毛驤看到胡念渠時，此人還在那叫嚷著要“殺掉顧正臣”，感情胡家災難都是顧正臣帶來的，是顧正臣毀了胡家。這小子也有膽，公然要弄死顧正臣，這話胡惟庸都不敢當著外人說……
胡惟庸入獄，結黨謀逆徹底敗露，整個案件變得清晰、明確。
按道理，這個時候是應該收手了。
朱元璋有了廢除丞相的充分理由，畢竟丞相參與謀逆，胡惟庸還親口言說了丞相製度危害，可朱元璋明顯還沒有達到想要的目的，絲毫沒有收手的打算，而是命令毛驤追查胡惟庸同黨都是有哪些人！
毛驤硬著頭皮，嚴刑逼供，結果陸仲亨又將南雄侯趙庸拉下水，趙庸曾跟著李文忠攻慶陽、應昌，應昌功勞最大，隻是因為想舒坦，在應昌私納奴婢，原本可以封公，追上李文忠的，結果隻給了南雄侯。
趙庸心生不滿，這才被胡惟庸拉為同黨。
朱元璋看過之後，直接下令抓人，毫不手軟。
風潮依舊。
朝廷六部官員中，被抓之人也在增加，朝堂之上人心惶惶，這種恐慌的氛圍，讓許多官員連睡覺都不安穩，總擔心有人半夜踹門，上朝之前還要三步一回頭看看家人，生怕是永彆。
自胡惟庸入獄之後七日，被抓的大小官員、勳貴武將已不下二百人，眼看沒個儘頭，馬皇後也坐不住了，勸說一番並沒奏效，一氣之下出了皇宮，住到了格物學院。
顧正臣被馬皇後一頓數落，完事之後道：“該死的死，不該死的不能枉死，你也是陛下的臣子，是大明的臣子，豈能躲在格物學院裡麵充耳不聞，過清閒日子？若那些人枉死，你能安心嗎？”
一頓大義輸出，又打了感情牌，還不忘拿手絹擦眼睛。
顧正臣看著不講理的馬皇後，鬱悶不已。
你皇後勸都不管用，我算什麼啊……
但沒辦法，馬皇後逼自己出手，不管結果如何，都必須去皇宮一趟了。
顧正臣召來醫學院院長趙臻，讓趙臻帶幾個人，準備好東西陪自己去一趟金陵城，考慮到觸怒朱元璋的後果難料，顧正臣特意將朱老四、朱橚帶在了身邊，一頓洗腦：“先生這次出手，必然會惹怒陛下，若是陛下震怒要抽先生，你們身為弟子一定要攔著點，皇後也說了，你們要聽先生的話……”
朱棣看著顧正臣，搓了搓冰冷的臉：“那萬一父皇打我們……”
“怎麼會，你們是陛下的兒子，是皇子，陛下如何都不可能將鞭子抽在你們身上，隻管攔著。”
“既是如此，那為何先生讓醫學院的人跟著？”
“陛下親自動手，你們能攔得住，可若是陛下不親自動手，你攔不住啊，先生這不得準備好，挨打之後能少吃點苦……”
朱棣、朱橚敬佩，還是先生，算無遺策，準備周到。
武英殿。
當朱元璋聽到顧正臣求見時，眉毛一挑，命其進來，看著被朱棣、朱橚抬著進來的顧正臣，抬了抬手，讓內侍退下。
顧正臣躺在擔架之上，抬了抬手：“臣身中煙毒，還沒過兩個月，無法起身，還請陛下饒恕無法行禮之罪。”