在武英殿發完火還不夠，朱元璋當即召開了朝會，廷議對策。
朱元璋威嚴的目光掃過眾文武官員，語氣森冷地說道：“倭寇進犯，東莞流血！你們如何看？”
藍玉率先走出，行禮道：“陛下，倭寇之患日久，臣請旨發兵征討！給其一個顏色看看！”
禮部侍郎高信走出：“臣附議，當立即發兵征討，並整頓廣東諸衛，調南洋水師協防沿海，追剿倭寇，不給其喘息，以昭大明國威！”
藍玉轉頭看向高信，然後對朱元璋喊道：“咱說的是征討日本國，小打小鬨，算得了什麼！不將其打疼了，這倭寇問題，十年，百年也未必能解決！”
“東南水師連廣州都防不住，連沿海百姓都護不了，如何能遠渡大海，前往日本國？”高信反問之後，對朱元璋道：“陛下，臣以為，不僅要追剿倭寇，還需要調查清楚，東南水師到底在乾什麼，為何讓倭寇上了岸！故此，臣——彈劾東南水師總兵顧正臣，參將張赫、趙海樓等人！”
李文忠板著臉走了出來：“今日論的是倭寇虐殺東莞百姓之事，為何又將這事扯到定遠侯身上？”
高信盯著李文忠，沉聲道：“敢問曹國公，若不追究東南水師的責任，誰敢保證明日不會再有一個東莞遭遇倭寇入侵？唯有問責到底，一查到底，方可整頓軍紀，加強沿海布防，護百姓周全！難不成，殺了這一批倭寇，就沒有下一批倭寇了嗎？東南水師耗著大量國帑，卻沒有護住百姓，難道不應該為此等血案負責嗎？”
李文忠憤怒地喊道：“東南水師，東南水師！好像在你嘴裡，有一個東南水師就能包打天下了，護了東南所有海域了？東南水師一共才多少人，他們既要護衛商隊，又要遊弋各地，還要坐鎮南洋，還有一支在定遠侯的帶領下出了大海去尋找治療癭病的藥物！你來告訴我，讓你去當東南水師總兵，你能確保哪裡都能安全，哪裡都沒有賊寇進去嗎？若是你敢保證，我李文忠這就給陛下請旨，讓你掛印！”
高信沒想到李文忠的火氣這麼大，他平日裡算是脾氣好的了。
可事已至此，高信也不好退，隻好對朱元璋道：“東南水師有責，便該問責！”
朱元璋嗬了聲，厲聲道：“東莞百姓為倭寇所害，還是為東南水師所害，朕看你是沒想清楚啊。怎麼，韓宜可的公文看不懂，還是說那一張張令人心驚的圖畫看不明白？東南水師的責任，朕自會安排人查辦！現在，要論的是倭寇，是倭人！你們凡事——都朝著顧正臣身上掛。”
高信感覺到了朱元璋的殺意，不敢再說什麼，隻好退了回去。
李文忠進言：“陛下，倭寇行徑，天地不容！若不懲戒以雷霆，百姓何以歸心，朝廷還以有顏麵告慰百姓？臣認為，一應該命令各地沿海衛所，加強防備。二應讓東南水師總兵自南洋抽調兵力，協助沿海衛所追剿倭寇。三應該給日本國一個教訓，讓其知我大明國威！”
兵部侍郎李澄皺了皺眉頭，走出來道：“陛下，曹國公所言一二並無問題，但第三點，臣不讚同。”