加工處負責食物的再加工，比如發酵、濃縮、稀釋、精煉等，有下屬的工坊和工匠螞蟻。
此外，軍用蒼蠅、甲蟲的馴養叫軍事部管理，農業部不管。一些非糧食類物資的采集，如植物纖維的采集，由工業部管理，農業部也不管。
工業部管理全國的高爐、作坊，下轄金屬工業處、非金屬工業處、原材料處等。
如今神使王軍團相比其他蟻族有著更加強大的工業製造能力，能夠生產鐵製品等“高科技”產品，主角決定把工業的地位放到更高層麵，因此組建了工業部。
第一任工業部部長是原先管理煉鐵高爐的一隻大頭蟻神工蟻，名為“小石”。
金屬工業處管理煉鐵高爐等工坊，根據上級命令製定生產計劃。
非金屬工業處負責管理生產石器、陶器、繩索、木器等的作坊。
原材料處負責所有工坊所需原材料的收集，有一支龐大的工蟻隊伍，不像以前那樣，和農業部的外出采集食物的螞蟻是混為一談的。
科研部由“小秘二世”領銜，由原科研組改組而成，原先的幾個科研小組根據研究方向被改組為下屬部門，包括：農業科技處、工業科技、軍事科技處、其他科技處。又新組建了後勤保障處、安保處作為行政處室。
主角對科研工作非常看重，為此給科技部專門配備了安保力量。
工程部主要負責國境內重要工程的施工，目前的大運河工程及其施工隊就移交給了工程部。
工程部部長是一隻鋪道蟻雄蟻“浮葉二世”，部裡下轄規劃處、施工處等機構。
交通部負則大宗物資的巢穴間運輸，目前的部分甲蟲運輸隊全部劃歸交通部管理，不過他們隻負責非軍事運輸。
交通部下轄計劃處、運輸處、馭獸處等，部長是舉腹蟻雄蟻“老心”。
外交貿易部負責與其他文明蟻族的外交和貿易事宜，下轄外交處和貿易處，部長是經常執行外交任務的神工蟻“小花”。
教育部負責雄蟻、神兵蟻的軍事教育，神工蟻、大工蟻的職業教育等，為軍事部、財政部、科技部、農業部和工業部培養專門的蟻才，也負責雄蟻等的常規教育。
教育部下轄軍事教育處、職業教育處、普通教育處，教師多是從相關崗位上退休的有經驗的螞蟻，部長為大頭蟻雄蟻“甲牛”。
各地副巢的日常行政工作由當地的雄蟻、蟻後、雌蟻、大工蟻、神工蟻、神兵蟻組成副巢會議管理，同時接受本蟻族以及十部的垂直管理。
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