傑可羅拉群島的旅行在客船抵達了枯葉市後，也預示著小智合眾地區的旅行結束了！三色堇要去真新鎮訪問大木博士與小智一起，艾莉絲要去城都地區的煙墨市，天桐要去芳緣地區武鬥鎮參加哈奇老人舉辦的釣魚大會。
小智道：“那麼我們到這裡就要分彆了！枯葉市有直接到達金黃市的地下鐵，金黃市有轉乘的地下鐵能直接到滿金市，從滿金市到煙墨市也就不遠了。天桐你可以去到城都的淺蔥市那裡也有直接到芳緣的客船。”
天桐興奮道：“真是期待呢！艾莉絲那我們到半途都還可以一起行動嘍！”
小智和三色堇送天桐和艾莉絲到了列車站，三色堇還特意去買了枯葉市的特產鐵甲貝便當。
小智道：“艾莉絲接下來在小椿小姐那邊要好好修行哦！天桐釣魚比賽要加油哦！”
兩人同時點頭，艾莉絲道：“能跟老師一起旅行，我覺得很開心呢！”
天桐道：“我從小智身上學到了很多，這真是一場非常有意義的旅行呢！”
隨著廣播中發車的聲音響起，列車門緩緩關上了，艾莉絲不舍道：“老師再見了！”
天桐道：“小智以後再見吧！”
小智道：“祝你們旅程愉快！”
天桐和艾莉絲離開了，小智的合眾之旅落下了帷幕。
真新鎮外，小智笑道：“有段時間沒有回來了！皮卡丘懷念嗎？”
“皮卡！”
小智道：“三色堇小姐，你隻要順著這條路就能直接到大木博士的研究所了！我要先回家一趟！”
三色堇笑道：“好，那小智博士就等會見了！”
小智推開了家門，吸盤魔偶就撲向了小智，小智道：“吸盤魔偶你還好嗎？”
“吧裡吧裡！”吸盤魔偶點了點頭。
“歡迎回來！”兩道聲音同時響起，花子和小霞一起走了出來。
皮卡丘從小智的肩膀上跳到了花子的懷中，花子道：“歡迎小智和小皮卡回家！”
小智道：“我回來了！小霞！”
小霞拿過小智的背包道：“你難得回來，我跟科拿小姐請了假，要來幫你慶祝的嘛！洗澡水已經放好了，小智你和皮卡丘都先去洗洗換身乾淨的衣服吧！”
小智滿意的點了點頭，將小霞攬入了懷中，笑道：“我的小霞就是溫柔！小剛見到的話隻怕會嚇死！那我就先去洗澡了！皮卡丘走嘍！”
盛大的慶功宴開始，這次的慶功宴是在阿爾薩斯自然公園中舉辦的，小智所有的寶可夢都參加了，三色堇還是第一次見到這許許多多的神獸同聚一堂的樣子忙著拍照片，吃都幾乎沒有顧上。
火箭隊三人的那邊，他們回到了關東之後就先回了總部，他們將這次等離子團覆滅的消息當作他們的成果彙報給了阪木。阪木詢問道：“那之後呢？還有什麼成果？”