夏季四月丁酉日，皇帝親自測試翰林官成克鞏等人。庚子日，皇帝在太和殿召見前來朝覲的官員，並訓誡後遣送他們離開。他下諭旨說：“國家用人，內任者要熟悉法紀綱常，外任者要熟悉民俗民情，經過內外曆練，才能見真才實學。現在親自測試詞臣，對於未被留任的，酌情改授其他職位，按照詞臣外轉的舊例，給予他們司、道等官職的優待。”並首次命令吏部、都察院進行京察。甲辰日，免除了湖南六年至九年的拖欠賦稅和山西夏縣的荒賦。丙午日，任命佟國器為福建巡撫。丁未日，任命圖海為弘文院大學士。壬子日，由於旱災，皇帝下詔求直言，並減少刑罰和監獄的使用。甲寅日，命令提學禦史、提學道清理整頓學政，確定學額，禁止冒名頂替。同時，改變民間充解物料的折收方式，實行一條鞭法。丁巳日，確定了滿族官員離任後持服三年的規定。己未日，任命成克鞏為吏部尚書。癸亥日，免除了福州等六府九年以前的荒賦三分之一。
五月甲戌日，停止禦史巡按直省。免除了祥符等七縣九年的災害賦稅，以及沔陽、潛江、景陵八年的災害賦稅。乙亥日，封鄭芝龍為同安侯，其子鄭成功為海澄公，其弟鄭鴻逵為奉化伯。任命喀喀木為靖南將軍，征討廣東的殘餘寇賊。同時，免除了曆城等六十九州縣八、九年的災害賦稅。丁醜日，確定了表彰宗室節孝貞烈的條例。己卯日，皇帝下詔說：“天下剛剛平定，創傷尚未恢複，連年水旱災害，百姓無法生活，饑寒交迫，被迫為盜。雖然盜賊眾多，但其中豈無冤屈和濫殺，許多人是被脅迫而陷入其中，難以自拔。想到這些人民，誰不是皇帝的子民，摧殘他們容易，但要使他們生息繁衍卻十分困難。如果一概誅殺，實在令人痛惜。因此，特降特殊恩典，從寬處理，如果能改悔，都允許他們自新。各地官府要妥善安置他們，士兵仍回軍隊，百姓則返回務農。如果不願回鄉，也可以讓他們留在原地，不要讓他們失去住所。讓所有人都知道這一點。”庚辰日，確定了熱審的條例。乙酉日，追封舒爾哈齊為和碩親王，額爾袞、界堪、雅爾哈齊、祜塞為多羅郡王。同時，免除了武昌、
漢陽、黃州、安陸、德安、荊州、嶽州九年的災害賦稅。庚寅日，加封洪承疇為太保，負責經略湖廣、廣東、廣西、雲南、貴州等地。壬辰日，任命張秉貞為刑部尚書。甲午日，免除了霸州、保定等三十一州縣九年的災害賦稅。
六月乙未朔這一天，皇帝追封塔察篇古、穆爾哈齊為多羅貝勒。在丁酉這一天，皇帝發布諭旨說：“帝王治理百姓，以德行來教化他們，以禮儀來規範他們，隻有在不得已的情況下才會使用刑罰。法律是天下公平的標準，不是根據帝王的喜怒來決定刑罰的輕重。過去，臣民犯罪，一定會交給相關部門商議，因為司法官員的責任，就在於明察秋毫，公正無私。 然而，有時卻有人私心揣度，事情一旦上報給皇帝，就重擬罪名等待皇帝裁決；援引舊案時，又故意用苛刻的言辭來加重罪名。我作為皇帝，對百姓寬大為懷。對於那些因饑寒而偷盜的百姓，我還允許他們自首；對於遠方尚未歸順的**，我也給予招撫。更何況是對於朝廷的官員和百姓，我怎能忍心讓他們遭受冤屈和濫用刑罰？從今以後，司法部門必須查明真相，引用法律條文，徹底革除羅織罪名的行為，以達到刑罰的公正和適度。”大學士高爾儼被免職。癸卯這一天，恢複了秋決朝審的慣例。乙巳這一天，命令祖澤遠專門督察湖廣地區，孟喬芳兼督四川地區。丙午這一天，免除了慈溪等五縣八年的災害賦稅。辛亥這一天，賜予已故明朝殉難大學士範景文、戶部尚書倪元璐等人及太監王承恩十六人諡號，並賜給祭田，所在地區的官員都要去祭奠。全國範圍內的本色錢糧改為一條鞭法征收。癸醜這一天，貝勒吞齊等人在寶慶打敗了孫可望。庚申這一天，任命李率泰為兩廣總督。慈寧宮建成。辛酉這一天，增加了內三院的漢大學士，每個院各有兩人。癸亥這一天，皇帝發布諭旨說：“唐、虞、夏、商時期沒有使用宦官，到了周朝也隻是