三月，由於雲南南部已平定，皇帝向太廟和陵墓報告了這一喜訊，並宣布赦免天下。辛卯日，是皇帝的萬壽節。己亥日，皇帝派遣官員安撫浙江、福建、廣東新歸附的官員和民眾。
夏季四月丙辰日，皇帝為太祖和太宗上尊諡。
五月戊寅日，夏至，皇帝親自到方澤祭祀地神。
六月丁未日，皇帝命令禮部考察並確定貴賤等級和相應的禮儀。
秋季七月壬申朔日，任命車克為大學士，寧古禮為戶部尚書，張傑為浙江提督，施琅為福建提督。
八月辛醜朔日，大學士金之俊被罷免。
九月，裁撤了延綏巡撫的職位。
冬季十月壬寅日，任命成克鞏為大學士。癸卯日，尊稱皇太後為太皇太後，尊稱皇後為仁憲皇太後，母親為慈和皇太後。
十一月辛巳日，冬至，皇帝在圜丘祭祀天神，並免除了朝賀的儀式。
十二月辛酉日，皇帝命令吳三桂總管雲南、貴州兩省的事務。
這一年，全國的人口和戶數統計為一千九百一十三萬七千六百五十二戶丁，征收的銀兩總計為二
千五百七十二萬四千一百二十四兩零。鹽稅收入達到了二百七十二萬一千二百一十二兩零。鑄造的錢幣數量超過二萬九千萬枚。直隸、江南等地區的州縣因災害而減免了部分賦稅，減免額度各有不同。朝鮮向朝廷進貢。
二年癸卯春正月己亥日，廣東總督盧崇峻請求允許民間船隻協助軍隊，但這一請求被駁回。
二月庚戌日，慈和皇太後佟佳氏去世。
三月，荷蘭國派遣使者進貢，並請求協助朝廷討伐台灣，朝廷對他們進行了優厚的賞賜。
五月丙子日，任命孫廷銓為大學士。乙酉日，雲南設立鑄錢局鑄造錢幣。丙戌日，頒布詔令，全國的稅收和糧食供應統一歸戶部管理，各部寺需要使用的，都需向戶部申請領取，這成為了一項法令。戊子日，任命魏裔介為吏部尚書。甲午日，為已故的慈和皇太後上尊諡號為“孝康慈和莊懿恭惠崇天育聖皇後”。
六月，世祖