十二月辛醜日，新月初一，皇上命令徐廷璽協助管理河務，並命令尚書馬齊，侍郎喻成龍、常綬去視察河工。庚戌日，皇上諭令宗人府：“對於那些閒散的宗室成員，如果他們有才能、擅長騎馬射箭，或者貧窮無以為生，你們都要詳細調查並報告給我。”皇上下詔規定，因公事牽連的官民妻女，不得拘禁審訊，這成為了一項法令。同時，皇上將四川的東川土司改為東川府，並設立了知府以下的官員。戊午日，皇上下詔要求八旗察訪孝子節婦。己未日，任命巴錫為雲南貴州總督，馬自德為京口將軍。己巳日，皇上在太廟舉行了合祭祖先的儀式。
這一年，皇上免除了直隸、江南、福建、浙江、湖廣等省的三十五個州縣因災害而欠繳的賦稅，數量不等。朝鮮也向清朝進貢。
三十八年己卯年的春天正
月辛卯日，皇帝下詔說：“朕將南巡檢查河工，所有所需供應，都由京城準備。預先告誡官吏，不要給百姓帶來負擔。”
二月壬寅日，詹事尹泰因不稱職被解職。癸卯日，皇帝奉皇太後南巡啟程。戊申日，因天津總兵潘育龍訓練有方，賜給他禦服貂裘。
三月庚午日，皇帝到達清口，奉皇太後渡河。辛未日，皇帝乘小船，親自視察高家堰、歸仁堤、爛泥淺等工程。截留漕糧十萬石，發放給高郵、寶應等十二州縣平價出售。壬申日，皇帝視察黃河堤防。丙子日，皇帝車駕駐在揚州。下諭令隨從兵士不要踐踏麥田。壬午日，下詔免除山東、河南的拖欠賦稅，對死罪以下的**進行特赦。癸未日，皇帝車駕抵達蘇州。辛卯日，皇帝車駕駐在杭州。丙申日，皇帝閱兵並進行射箭比賽。戊戌日，皇帝奉皇太後回京。
夏季四月庚子日，皇帝回到蘇州。下詔免除鹽稅、關稅加增的銀兩，特彆增加江、浙兩省的學額。乙巳日，任命丹岱為杭州將軍。己酉日，皇帝車駕抵達江寧。皇帝閱兵。庚申日，到達揚州。辛酉日，任命彭鵬為廣西巡撫。丙寅日，渡過黃河，皇帝乘小船視察新修的堤防。
五月辛未日，皇帝到達仲家閘，題寫“聖門之哲”的匾額，懸掛在先賢子路祠。乙酉日，皇帝奉皇太後回宮。丁亥日，任命馬爾漢為左都禦史，王鴻緒為工部尚書。
六月戊戌日，起用郭琇為湖廣總督，任命鎮國公英奇為蒙古都統。
秋季七月甲申日，黃河在淮、揚地區決堤。
閏七月戊戌日，敏妃張佳氏去世。她的兒子誠郡王胤祉，因為不滿百日就剃發，被降為貝勒。癸醜日，之前，苗賊黃明多次報告捕獲或死亡，但仍報告有犯事。到這時，皇帝派官員調查，並將他和他的同夥陳丹書、吳思先等三十餘人誅殺。對於奏報不實的督撫麻勒吉等人，分彆給予降職或罷免