撤退命令下達，駐紮在亞鬆森的巴西士兵們鬆了口氣，簡單休息一晚，11月12日上午，天剛蒙蒙亮，第一批守軍便開始了撤離。
11月18日，桑托斯最後看了眼冒著熊熊大火和濃煙的亞鬆森城，然後遺憾得轉身離去。
巴西守軍在撤離之前，對亞鬆森城和沿線防禦工事進行了徹底的破壞，一些從後方長途轉移至前沿的彈藥物資、重武器，因為不方便隨軍攜帶搬運，被放棄在城內，隨亞鬆森城一塊被摧毀、破壞。
11月20日，2萬餘漢軍前沿部隊，搭乘軍艦、蒸汽運輸船抵達亞鬆森，看到的卻是被破壞得麵目全非的殘垣斷壁。
亞鬆森城被徹底摧毀，前沿部隊短暫停留半天，留下一千人占領並清理可能逃散的殘敵，剩餘部隊繼續沿著巴拉圭河向北突進。
11月22日，前沿部隊抵達康塞普西翁，
與尚未來得及撤離的一部守軍交火。
24日，康塞普西翁港口被攻破，3000餘守軍被俘虜。
25日，距離巴西主力部隊撤離亞鬆森過去十二天，桑托斯帶領的最後一支殿後部隊也抵達了巴西共和國境內，漢軍前沿部隊一路尾隨追擊，相繼收複沿線巴拉圭領土。
27日，因戰線拉長，運輸補給不暢，前沿部隊暫時停下追擊腳步，在巴拉圭與巴西共和國交界處停了下來，並向後方通報戰況。
巴拉那流域方向，11月20日杜瓜伊蘇港口守軍得到桑托斯帶領部隊撤離的消息，於11月22日開始撤離，期間遭遇漢軍自巴拉那河北上的追擊部隊，巴拉那戰線敵軍丟下一部約6000人的殿後部隊，狼狽逃回國內。
11月19日夜晚，虎美塔要塞殘餘守軍集中兵力向東部方向突圍，戰至第二天淩晨，除3000餘人突破防線，成功逃脫外，剩下約1.5萬人被漢軍阻擊，於11月21日放下武器投降。
11月26日，穿越原始森林和丘陵山區，僅剩下1000餘人的虎美塔殘軍，遭遇一支規模約4000人，自巴拉那河流域西進的漢軍二線警備部隊，長途跋涉、疲憊不堪，丟掉所有重武器的虎美塔殘軍不是漢軍的對手，交手不到一個小時，在戴維斯少將被擊斃後，剩下約800名殘軍，在米勒少將帶領下，無奈投降。
虎美塔方向3.2萬人全軍覆沒，比亞裡卡方向2萬人被殲滅，瓜伊拉失守損失4000人，
撤離過程中，杜瓜伊拉港口損失6000人，康塞普西翁損失3000人，算上各部追擊作戰中，陸續殲滅的約3000巴西殘兵敗將。
截止1889年12月2日，漢軍收複除原巴西南馬托格羅索州、戈亞斯州等外，全部巴拉圭領土，野戰軍、警備軍總計傷亡約3600人，民兵、隨軍民夫傷亡約3000人，殲滅、俘虜敵軍6.8萬人，成功逃回本土的巴西軍隊總數約7.2萬人。
隨著雨水的再次降臨，巴拉圭戰事再一次被按下暫停鍵，漢軍各部皆停下作戰腳步，一方麵分派部分兵力，深入巴拉圭各地清繳殘軍和抵抗武裝，加強對巴拉圭基層的掌控，另一方麵修整、集結，等待後方的彈藥、物資補給。
曾經的巴拉圭也是一個相對繁榮、具備一定工業基礎的近代國家，老洛佩斯執行開明的經濟政策，鼓勵並引進英國、法國、奧匈帝國、德國等國家的投資。修建了一定數量的鐵路，建設起了一批造船廠、鋼鐵廠、醫院、學校，甚至還在1857年，在首都亞鬆森，鋪設了有線電報，可惜，經曆1868年第一次巴拉圭戰爭和1889年第二次巴拉圭戰爭的兩次摧殘，老洛佩斯遺留下來的少量工業化的產物，被摧毀殆儘。
最後一段數百公裡，相對完整的鐵路，也在巴西共和國軍隊撤離的過程中，被一一爆破、破壞。
繁華、莊嚴的亞鬆森皇宮被炸藥、大火徹底摧毀，隻留下一節節熏黑的石柱、一塊塊破碎倒塌的大理石，昭示著往昔的輝煌。
哥特式的巴拉圭國家大劇院，也像這個國家一般，倒塌、沉淪。
國家人口經曆二十年緩慢增長，以及算上從巴西手中搶來的南馬托格羅索州、戈亞斯州西南部、馬托格羅索州南部等地區，總數量不過60餘萬，再次經曆戰爭摧殘，除去被巴西共和國占領的南馬托格羅索州、戈亞斯州西南部、馬托格羅索州南部，原巴拉圭本土總人口下降至30餘萬。
人口凋零、青壯男性損失慘重，再加上被徹底破壞的鐵路、港口、公路等交通，導致漢軍的進攻，被影響和限製，不得不暫時停止。
巴拉圭境內的戰事告一段落，漢國本土，靠近前線的香河市卻依舊一派緊張、忙碌的景象。
香河市是原阿根廷米西奧內斯省首府，漢國占領阿根廷後，根據地域優勢和國家產業規劃，將這裡建設成為了，本土北部巴拉那河流域的一個重要交通樞紐。
從鬆江府延伸而來的鐵路在這裡與林州、振州、光州方向的鐵路交彙。