根據這條指令，所有克隆人士兵都將對每一個絕地武士進行就地格殺！結果就是，那些正在前線奮戰的絕地武士們，在毫無征兆的情況下就被和自己出生入死三年的戰友從身後開槍殺死！
除了少部分極為出色的絕地武士逃過這一劫之外，總共一萬多名絕地武士死在66號指令之下！
在清除了絕地武士團之後，達斯-西迪厄斯直接撕下最後的偽裝，宣布銀河共和國改組為銀河帝國，自己，就任帝國皇帝！
當然，在達斯-馬薩伊爾來到這裡之後，他自然不可能讓達斯-西迪厄斯這麼舒舒服服的完成自己權力的整合，在一切準備完全之後執行66號指令消滅絕地武士團，登基稱帝。
這樣的結果，隻能是接下來的銀河帝國迅速整合完成國內的權力和利益分配，迅速重新走上戰爭和強權的道路。
但另一個角度，達斯-馬薩伊爾也不希望絕地武士團在66號指令之下幸存。他和絕地武士團之間，絕對就是不死不休的關係，僅僅隻是他的存在，就不可能被絕地武士團允許。所以，絕地武士團的覆滅，卻也成了他和達斯-西迪厄斯之間唯一還有默契的事情。
所以，達斯-馬薩伊爾就設計了這麼一個計劃——他在十多年前，被達斯-普雷格斯派去殺死可能造成納布之戰計劃泄露的洛恩-帕萬的時候，就留下了這麼一個心眼，將洛恩-帕萬得到的情報隱藏在他的機器人i-5yq身上，並且讓超蓮花把這個情報隱藏得非常巧妙，讓賈克斯-帕萬沒這麼容易找出來。溵
這樣一來，i-5yq就成了達斯-西迪厄斯和絕地武士團兩者的不定時炸彈！一旦其中的情報被賈克斯-帕萬察覺，他肯定會上報給尤達大師，而絕地武士團也肯定會作出反應。同時……達斯-西迪厄斯，自然也會立刻著手對付絕地武士團。
於是這樣的結果就是，達斯-西迪厄斯在準備不充分的情況下被迫對絕地武士團動手，而這時候他手中的權力還沒有完成整合，自然將會付出巨大的代價。
而另一方麵，因為66號指令的存在，絕地武士團也有很大的概率被達斯-西迪厄斯消滅，但是存活下來的絕地武士也肯定比原劇情的66號指令更多！
這樣一來，他的目的就完全達到了。
現在，在得知科洛桑突然進入封鎖狀態的情報之後，達斯-馬薩伊爾立刻就明白，這個不定時炸彈終於引爆了。現在的他隻需要坐山觀虎鬥就好，但也不意味著什麼都不做，他需要到科裡班星球來，去完成他沒有完成的黑暗儀式。
達斯-西迪厄斯一直盯著科裡班，他知道讓達斯-馬薩伊爾完成儀式的危害，所以上一次達斯-馬薩伊爾來到科裡班的時候，他就迅速趕來，並且在馬卡-拉格諾斯的幫助下擊退了馬薩伊爾。
達斯-馬薩伊爾自從那次也知道，如果達斯-西迪厄斯一直盯著自己，自己是不可能達成目的的。溵
所以，必須等到他無暇他顧的時候，而這時候，就是現在！！