在教會與“外婆”一同合作完成了關於認知的全部實驗之後，教會便開始了他們的清理工作。
由於教會的的存在一直屬於秘密，如若不是入教的話，那麼他們儘量不會讓人知曉有關教會的核心秘密。
這也是為什麼雖然教會在敘拉古地區擁有了那麼多的黑幫力量，但卻依舊沒有讓他們知曉有關教會和深海的秘密。
雖然教會裡的主戰派謀求擴張，但他們也知道發展過多教徒很容易引起各國高層的注意，尤其是伊比利亞高層。
所以即便是主戰派，也很配合主和派進行循序漸進的傳教活動，逐漸發展他們的勢力，這也是為何教會選擇在敘拉古扶持代理人的一大原因，他們的存在不能擺上台麵。
不過那是以前，現在情況不同了，在有了幽靈鯊改造血液之後，他們會給大量和他們有關聯的人進行人體改造，將他們變成教會的預備役，平時並不和他們接觸傳教，那些人也不清楚教會在搞些什麼花樣，一旦有什麼情況教會就將他們變異成海怪，來充當教會的戰力。
隻是在當時，教會選擇了與“外婆”的合作導致了“外婆”的人員知道了教會非常核心甚至可以說是絕密的信息，所以教會必須要將“外婆”組織給處理掉。
鑒於當時實驗結果還未完善，教會依舊需要“外婆”的科研人員，所以當時教會向“外婆”發起了邀請，讓他們正式加入深海教會。
但此時“外婆”組織內部的人員反而發生了分歧，在關於是否跟隨教會的問題上，組織內部的人出現了爭論。
以埃斯波西托為代表的一部分人認為教會是能為他們提供機會的絕佳發展平台，那令人震驚的科技和充滿吸引力的深海，讓他們對之前從未了解過的領域充滿了向往，加入深海教會無疑是非常好的選擇。
他們的想法其實也不無道理，在科研氛圍濃厚的“外婆”裡，即便是後來選擇不加入教會的人也承認，教會提供的技術令他們耳目一新，深海的技術或許更加不可思議。
但另一部分人有著他們的擔憂，雖然他們早就已經是屠殺過無數魯珀族的劊子手，但卻依舊對教會的手段和主張感到懼怕。
這種懼怕來自於無法理解與未知，麵對詭異的教會和聞所未聞的深海，他們猶豫、恐懼、保守，這些情緒在實驗過程中就曾徘徊在“外婆”組織內部的部分人之間。
但真正讓他們選擇退縮的一個重大原因，還是因為海嗣的出現。
當他們第一次見到海嗣的時候，就直接被海嗣那強大的力量和超出認知的表現給完全震懾到了。
初到敘拉古的海嗣展現了強大的深海之力，將教堂全部融入了它的身體，並且伸出令人噩夢連連的觸手。
強大的精神力甚至讓體內完全沒有深海之力的他們都感到了精神錯亂，他們至今都對那種體驗感到後怕。
對他們來說，那是一種出於本能的懼怕，但凡是個正常人見了那個東西第一時間想到的就應該是跑，他們根本無法理解教會為何會崇拜如此詭異的生物，也因此對教會和深海敬而遠之。
除了瘋子，或許沒人會認同那群怪物，當然，組織內不是沒有這類人，包括埃斯波西托在內的一部分人甚至因此對深海展現出了崇拜，他們也迅速為接近教會做出努力。
就這樣，“外婆”組織分裂成了兩批人，一批選擇接受教會的邀請加入了教會，不再是“外婆”的人，而另一批選擇離開教會打算另謀出路。
但教會可不是什麼善茬，他們可不會就這麼把“外婆”的人給放走，那些選擇不加入教會的人，都被教會給判了死刑。