就在這一夜，八路軍一二九師東進縱隊發動了漳南戰役。三八六旅六八八團和騎兵團從肥鄉出發，長途行軍，當夜包圍並攻打了賈河口、大營、東辛寨、張村集等土匪據點，俘虜了蘇啟明。郭清部在大營被擊潰，土匪死20餘人，投降被俘多人。在戰亂中，郭清見勢不妙，光著腳倉皇逃脫。
郭清受到八路軍突如其來的沉重打擊，成了驚弓之鳥，不敢在臨漳地盤久留，遂率殘部數百人轉移到磁縣、峰峰一帶活動。
土匪轉為漢奸
1939年10月，日本為了利用土匪武裝“以華治華“，成立“安臨特彆警備司令部“，任命王自全為正司令，郭清為副司令，郭清還兼任臨漳縣日偽二、三區區長。從此，郭清由土匪變成漢奸。
1940年春，郭清留金鳳鳴駐守北皋，他自己則親自坐鎮賈河口，控製二區五十三村，同時讓其弟郭誌在冉店成立黑局子控製第一區。其武裝力量日益增強，勢力範圍不斷擴大。
1941年4月，日本惟恐郭清不好控製，就預謀收他的槍。
一天日軍一個連開進賈河口，命令郭清配合向東南掃蕩。行至蒲灘營，日本人以私通八路為名，將以郭清為首的官兵六七百人用汽車帶走。郭清被押到安陽，經王自全講情才給了他幾支槍放回。
1943年5月，日軍正式把郭清部隊編為“冀南剿共獨立旅“，任其為旅長，派懂中國話的日本人石田為軍事顧問。隨後日軍一個班常駐賈河口。郭清受編後，明目張膽地按旅的編製，大量擴充軍隊，向各村攤派要兵。要一個兵，帶一隻槍、100發子彈，購置了兩部大汽車，50挺輕重機槍，3門小迫擊炮，設立了兩個團，一個獨立營，駐臨漳韓步雲的保安隊400人也屬他管，總人數達到2200人。旅部下設軍需處、書記處、參謀處、副官處，還有醫院、裁縫處、電話室、電燈房、審訊室等機構。同時在邯鄲、臨漳、成安、安陽還設有辦事處，控製範圍以賈河口為中心，東到魏縣城以西，廣平縣西南鄉，西到臨磁邊界，南至漳河，北到成安城南，方圓80裡。
郭清由土匪當上了鐵杆漢奸，公開與八路軍為敵，對無辜百姓實行殘酷迫害。
據1946年不完全統計，郭清在臨漳、成安、魏縣三地就殘害7000多人。
郭清是個土匪，又是個大毒品販。他與大毒品販王自全、和集廷等都有來往。1940年夏，郭清為販賣毒品，帶十幾個護兵全副武裝，騎著馬到崔家橋王自全那裡，馱回白料麵兩包袱。一兩白料麵兌換100塊現大洋。按這個標準來計算，郭清這一次販的毒品價值4萬塊現大洋。