之後去山川壇祭祀先農了，明毅宗穿著冕服很瀟灑地走在前麵，兩旁的南北鎮撫司錦衣衛校尉們持手跟隨，之後才是跟著的一班武大臣們，此祭是大禮由明戶部尚書：侯恂，在案幾前拿起一把小麥走到三個扛著金水盆的太監麵前，沾了一點水在小麥，意預五穀豐登風調雨順的意思。
由於外城距離附近居住的百姓房屋較近，所以引來許多百姓們的圍觀，隻見明太常寺奉祀緩慢走前打開手的祝念道“維神肇興農事，始種嘉穀，立斯民命，萬世攸賴，茲當東作之期，躬耕耤田，惟賴神慈，默施化理，俾年穀豐茂，率土皆同，以牲帛醴齊之儀，用申祭告之誠，尚享！”宣讀完畢之後皇帝陛下很有誠意的拜了三下插香，正當台下眾人們還在排隊插香時，明毅宗讓太監們幫他把平天冠摘下來，在卷起袖子親自下到田地裡耕種以示親民。
此舉讓百姓們看到了大明天子為國為民真乃一介好皇帝，雖然農祭是大禮但並不是每位皇帝都肯親自下田耕種的，所以明毅宗還是贏得了許多民心。
同時身受皇帝陛下囑托的明周皇後則移鳳駕帶領皇子、公主，以及後宮嬪妃們來到了北郊準備舉行祭祀先農典禮，明戶部左侍郎：黨崇雅，帶頭捧著六條蠶絲布衣走來遞給明周皇後並說道“皇後娘娘，接過此布條那可是要在宮織布一個月的，當然您也可以派人代織！”
但明周皇後非常耿直的說“不必了！本宮可以親自動手，開始念祝吧！”站在一旁穿著青衣祭服的明太常寺太祝：司馬瑭，揮手讓下人把祝拿過來打開念道“維神肇興蠶織，衣我烝民，萬世永賴、時維季春，躬行采桑禮，仰冀默垂庇佑，相茲蠶事，率土大同惟神之休，敬以牲帛醴齊之儀，用申祭告，尚享！”禮畢過後明周皇後率領身後眾人們下跪，雙手放在前麵行三拜大禮。
很快到了未時初回到華殿內的明毅宗，即刻下令明司禮監秉筆太監傳旨讓太醫院、禮部各派一位官員去祭祀先醫與四皇既，太醫院派出明太醫院禦醫：張炳良、禮部則派出明禮部祠祭清吏司主事：李安實，兩人一起前往景惠殿內，進殿後見到案幾麵擺放著的貢品分彆有；羊頭一隻、豕頭一隻、鉶二個、簠簋各二個、籩豆各八筐、帛一塊，被祭祀的醫師牌位分東廡和西廡兩處安置。
由明禮部祠祭清吏司主事設三壇先請東廡醫師十四位，既；僦貸季、天師岐伯、伯高、鬼臾區、俞跗、少俞、少師、桐君、太乙雷公、馬師皇、伊尹、神應王扁鵲、倉公淳於意、張機。
接著又請西廡醫師十四位，既；華陀、王叔和、皇甫謐、抱樸子葛洪、巢元方、真人孫思邈、藥王韋慈藏、啟玄子王冰、錢乙、朱肱、李杲、劉完素、張元素、朱彥修，這二十八個醫師神位請齊之後，明太常寺祀丞走台宣讀祝念道“仰惟聖神，繼天立極，開物成務，壽世福民，尤重於醫，所以讚帝生德，立法配品，惠我天民，功其博矣，時惟仲春、冬，特修常祀，尚冀默施冥化，大著神功，深資妙劑，保和朕躬，期與一世之生民，鹹蠲疾疚，躋於仁壽之域，以永帝之恩，不亦丕顯矣哉，以勾芒氏之神、祝融氏之神、風後力牧氏之神配，尚享！”這樣完成了祭祀醫師大典。
直到正月初9日才進行到了最後一步祭祀五神大典既，此刻整個紫禁城外城、內城、皇城，三處都分彆響起了鞭炮聲齊射炸天去，坐鎮在皇極殿內再次穿著冕服的明毅宗派明戶部員外郎：陶佩，前去祭祀司戶之神在宮門外道左設香案朝南。
同時在派明光祿寺寺丞：嚴華魏，前去祭祀司灶之神於內府大庖廚前道設香案朝南、還派明司禮監隨堂太監：沈韓馬，去祭祀溜之神於樓閣前設香案朝西、並派明金吾衛指揮使：呂施，去祭祀司門之神於午門前西角樓設香案朝東、明太常寺讚禮郎：魯友係，於內府大庖廚井前祭祀司井之神設香案朝南。