喬應甲還曾主持公道，將欺壓魚肉百姓的國舅曹應祥依法懲處，使其受到應有的懲罰。這一舉動使得百姓們紛紛稱讚，感到非常痛快。喬應甲的正義行為，不僅讓陝西的官場風氣得以淨化，也使得百姓們的生活得到了實質性的改善。
喬應甲在任陝西巡撫之時，恰逢陝北及關中地區遭受罕見的旱災與蝗災，百姓生活陷入水深火熱之中。然而，他的應對之策卻未能得到民心。
據史書記載，喬應甲不僅未有減免租賦、賑濟災民之舉，反而奉朝廷之命，增派賦役，加重了百姓的負擔。這種嚴苛的政策使得民不聊生，終致王二起義的火種被點燃。
王二聯合種光道等人，聚集了無數因災荒而走投無路的災民，在白水縣高舉義旗，公開反抗明朝的統治。這一事件無疑與喬應甲的治理政策有著千絲萬縷的聯係。
在王二起義的風雲之際，喬應甲的職位——陝西巡撫，毋庸置疑。他的政策決策對當時的社會穩定和百姓生活產生了深遠的影響，最終間接促成了這場曆史性的農民起義爆發。
朱由校並未對喬應甲痛下殺手。對於清官的處置，他始終保持了審慎的態度。曆史中，喬應甲曾因輕率決策，導致加收陝西農民重稅，致使民生疾苦，最終引發了王二起義。
然而，喬應甲的加稅決策實為奉朝廷之令。由此可以看出，大明朝末期，包括喬應甲在內的清官，也普遍缺乏體恤民情之心。大明朝或許氣數已儘。幸得朱少龍穿越時空，施行改革，挽狂瀾於既倒。
朱由校在陝西還沒有爆發農民起義之前，罷免了喬應甲的官，下聖旨任命孫傳庭為陝西巡撫。後喬應甲因病辭世於1627年，而大明朝得以再獲生機。
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