他心中生疑，覺得這其中必有蹊蹺。於是，他決定靜觀其變，看看神農究竟要搞什麼鬼。
隨後，眾人紛紛投身於尋找生還者的任務之中。在一片廢墟中，鳴人偶然發現了一個酷似史前遺址的神秘物體。
正當他們好奇地探索時，一個麵目猙獰的麵具蛇怪突然現身，它竟然附身在神農的女徒弟身上，發起了猛烈的攻擊。
在這場突如其來的襲擊中，小櫻不幸被打暈，而鳴人則目睹了佐助被蛇怪重創的慘狀。憤怒與決心瞬間湧上心頭，鳴人毅然變身成為半尾獸化，展現出他驚人的力量。
然而，麵對強大的蛇怪，僅憑鳴人的力量似乎難以匹敵。在關鍵時刻，柳天賜及時趕到救助，而鳴人因為自來也送的施加了封印的護身符，得以從九尾狀態恢複。
經過一番激烈的戰鬥，蛇怪終於因為女孩的蘇醒而消失無蹤。然而，在這場混亂中，小櫻卻從頭到尾都未能見到佐助的身影。
她心中充滿了擔憂和失落，但她知道現在不是沮喪的時候，她必須堅強起來，與眾人一起繼續前行。
隨後，大地突然發生了驚人的巨變，原本的遺跡仿佛被賦予了神奇的力量，瞬間升騰而起，化作了一座巍峨聳立的天空之城，漂浮在無儘的蒼穹之上。
柳天賜當機立斷，帶領著鳴人和雨琉來到了空忍的總部。然而，小櫻和雛田卻因為種種原因被迫留在了地麵，她們抬頭仰望，心中充滿了擔憂與不安。
在空忍總部，眾人發現了一個驚人的事實——神農，這位曾經被認為已經逝去的強者，竟然複活了！他站在眾人麵前，目光深邃，仿佛能夠洞察人心。神農開始解釋黑暗查克拉的奧秘，那是一種強大而神秘的力量，能夠賦予人超凡的能力。
隨著他的話語落下，他的身體開始發生變化，一股深邃而黑暗的氣息從他體內迸發出來，他的身體逐漸扭曲變形，最終化身成了一個麵目猙獰的人。這一幕讓在場的所有人都感到震驚和不安。
神農施展的，原來是一種名為“肉體化生”的禁術。這項禁術以肉體活化與再生為基礎，融入了零尾的暗黑查克拉，創造出了超乎想象的力量。通過此術，神農體內的細胞能夠發生逆轉，實現瞬間的年輕化，仿佛時光倒流。
神奇的是，肉體所受的損傷在這股力量的作用下，不僅得以恢複，還能轉化為再生的強化，使施術者獲得前所未有的究極肉體。
更令人震驚的是，這種力量甚至能讓他直接完全打開八門遁甲的八門，達到一個近乎不死不滅的境界。
然而，神農並未滿足於自己的強大，他開始不斷地用言辭打擊雨琉。那些言辭猶如鋒利的刀刃，一次次地刺入雨琉的心中。
在無儘的痛苦與絕望中，雨琉終於從打擊中恢複了一絲神誌。她鼓起勇氣，向神農表達了自己的心意，但得到的卻是神農冷漠的拒絕。