不知是要堅持“真理”，還是要維護自己內閣首輔的權威，楊廷和第二天竟仍然要求朱厚熜以太子之禮入城登基，禮部給出的章程也沒多少改動。朱厚熜自然極力反對，並表示禮部如果執意不改變章程，他就拒絕進城。
正在雙方僵持不下之際，一直沉默的張太後出麵調停了，她下了一道懿旨，讓群臣改在行宮中上表勸進，說白了就是讓禮部改用迎接皇帝的禮儀，將新君迎接進宮即位。
太後占著名分大義，以楊廷和為首的一眾文臣隻好作出讓步，即日在行宮中上了勸進表，朱厚熜這才同意擺駕進城入宮。之前議定的章程是從東安門入城，在文華殿即位的，不過現在改成從大明門進城，然後在奉天殿即位。
大明正德十六年，四月二十六日，朱厚熜在百官的見證下在奉天殿宣告即位，頒布登極詔書，改明年為嘉靖元年。登極詔書是楊廷和等內閣大臣早就議定好的，長達8800句之多，涉及60多個事項，自然都是些革故鼎新，籠絡民心的舉措。
譬如：正德年間，由於直言勸諫而被貶降的官員，全部官複原職，死了的便追封加賞後人；正德朝的大小傳奉官（不經科舉，皇帝直接任命的官員），全部革職；裁減宮中多餘的太監，清除軍隊中冒籍人員；減免賦稅等等。
事實上，登極詔書頒布後，光是錦衣衛和內官監便裁減了接近十五萬人，大大地節約了財政開支。楊廷和等大臣所擬定的登極詔書，雖然不可說完全沒有私心，但絕大部份都是民心所向的舉措，所以登極詔書一頒布，頓時大快人心，全國上下齊歌頌新君聖明。
當然，登極詔書是文官擬定的，自然對文官極為有利，而宮中的太監勢力卻是大受削弱，所裁減的人員有近半以上都是內官各監的太監。
另外，像司禮監太監張雄、東廠太監張銳、禦馬監太監張忠、宣府鎮守太監劉祥等均被關進了大牢待審，就連太監穀大用，還有內官監張永都被下獄了，不過穀大用迎接新君有功，最後免於問罪，被貶去南京守帝陵了。至於太監張永，此人功大於過，曾經又協助楊一清板倒了權閹劉瑾，所以文官們最後放了他一馬，同樣把他貶到南京守陵去了。
總的來說，這次新帝登基，文官集團大獲全勝，把正德朝權勢顯赫的太監都打掉了，就目前而言，太監集團元氣大傷，根本沒有力量再與文官集團抗衡。至少在嘉靖帝坐穩帝位，完全掌權之前，宦官集團再無興起的可能，畢竟他們的主子嘉靖帝現在都得看內閣的臉色行事。
大明正德十六年，五月初五，端午節，亦即是朱厚熜登基的第十天。
內閣大臣和六部尚書全部齊聚東閣，共計有：首輔楊廷和、次輔梁儲、三輔蔣冕、四輔毛紀、禮部尚書毛澄、史部尚書王瓊、戶部尚書楊潭、兵部尚書王憲、刑部尚書張子麟、工部尚書李鐩。另外都察院左都禦史王璟，右都禦史張綸也到場了。
在場的十二人均是朝堂中樞的大佬，此時齊聚一堂，自然是討論國家大事了。統共三件事，第一：討論新君親生父母尊號的問題。
第二：新君要起用前內閣大臣費宏，還有前翰林修撰費采。
第三：殿試的安排。
其實第二條沒什麼好討論的，新君登極詔書便寫得很清楚，但凡正德朝由於直言勸諫被貶降的官員，全部官複原職。所以，費宏兄弟回京複職的決議很快就獲得通過了。
至於殿試，眾人商議了一番，決定在本月的十五日舉行。
所以真正耗費時間的是第一條，給新君的親生父母定尊號，這在視禮如命的封建社會可馬夫不得。所以一眾大臣各抒己見，引經據典，彼此爭論得不可開交。
最後內閣首輔楊廷和一錘定音，他拿出了漢代定陶王、還有宋代濮王繼承皇位的例子，主張新君把弘治帝稱為皇考，而分彆稱親生父母為：皇叔考興國大王、皇叔母興國太妃。
換而言之，就是讓朱厚熜改認弘治帝為父，稱自己的親生父母為叔叔和嬸子，說白了就是把朱厚熜過繼給弘治帝為子。
楊廷和引用了漢定陶王、宋濮王兩個先例，有理有據，再加上他是內閣首輔，群臣的首領，所以這結果最後沒人反對，就這麼定下了，接下來就是將結果寫成奏本送去給朱厚熜過目。
然而，朱厚熜看到群臣討論出來的結果，頓時不樂意了，弘治帝是他的伯父，現在變成了他的父親，而親生父母卻為成了叔嬸，小皇帝自然不樂意啦，將奏本打回內閣再議。
如果說之前讓朱厚熜以太子之禮登基確實有點過份，但這次讓朱厚熜認弘治帝為父，楊廷和認為完全合情合理，更何況有前朝的先例。所以楊廷和這次的態度十分強硬，拒絕再議，把奏本重新呈送回朱厚熜的案頭。