在倭寇逃遁歸國後，除了明禦倭副總兵：劉綎，收留了5百倭軍編入本部火銃隊之外，其餘留在李氏朝鮮王國的倭軍要麼被殺、要麼投降明軍加入隊伍。
而東征的大明軍隊本應無戰事之後撤回國，但是李氏朝鮮宣祖昭敬郡王河城大君：李昿，唯恐倭奴積威，再度報複？
於是上奏朝廷表示要苦留大明軍隊善後，朝廷經過商議決定留明都察院右副都禦史兼朝鮮經略：萬世德，與明義州衛鎮撫使：李亟勳，率三千士兵繼續駐守李氏朝鮮王國，其餘明軍全部調回大明帝國。
12月20日，在大明帝國南方，明四川巡撫兼都察院左僉都禦史：譚希思，正在重慶府綦江縣、瀘州合江縣，一帶設防攔截楊氏叛軍，分彆在合江縣與綦江縣各置遊擊將軍一員，合江縣募兵一千二百人扼守岡門，綦江縣募兵二千人，扼守安穩。
怎奈前任明播州宣慰使：楊應龍，直接下令讓明下赤水裡長官：袁鼇，繞開守衛明軍，兵臨合江縣城下，抓捕出賣楊氏投降明軍的前任明下赤水裡長官：袁子升，處於淩遲之刑。
此事引起了上下赤水裡土司袁氏宗族的反對，要求前任明播州宣慰使撤掉袁鼇之位，改由袁子升長子：袁年，繼任下赤水裡長官。
剛剛即位的明下赤水裡長官：袁年，對於自己的殺父仇人近在咫尺卻不能報仇，因為有楊宣慰使的包庇，故此明下赤水裡長官密切聯係著上下赤水裡相近的仁懷裡王氏土司，打算監視播州宣慰使司的一舉一動。
接著又命令士兵前去攻打，之前彈劾自己的明草塘安撫使：宋世臣，父親：宋鑾，以及明黃平安撫使：羅承恩，等人，現藏在偏橋衛城內。
於是播州叛軍就襲擊了偏橋衛，還向明偏橋衛指揮使：陳天寵，索要城中之人，得到宋鑾、羅承恩及其下子女，慘遭殺害。
在令諸苗士兵當著父親之麵奸淫 女兒，或者當著夫君之麵淫 妻，或**坐在木叢中射箭取樂。又或者燒蛇入陰轉腹，人蛇俱死！還掘墳墓焚屍。
12月28日，明建州左衛軍民指揮使：愛新覺羅·努爾哈赤（佟·努爾哈赤）提前，一起合力備戰。
5月11日，朝廷調集了；四川都指揮使司、貴州都指揮使司、雲南都指揮使司、湖廣都指揮使司、廣西都指揮使司、陝西都指揮使司、浙江都指揮使司、陝西行都指揮使司、河南都指揮使司、山東都指揮使司、萬全都指揮使司、山西行都指揮使司，等地的明軍精銳總計17萬餘人直壓播州宣慰使司四境內。
待按其部署調足24萬大軍後，即開始了進剿準備，近鄰重慶府綦江縣還調集了三千兵，由明重慶衛右參將：房嘉寵，作為先鋒捕殺了播州宣慰使司叛軍三十人。