事情就這樣確定下來了。康熙率軍正麵追擊，費揚古帶北路軍包抄，直向西北窮追。不數月間，清軍連克阿巴哈納爾、二連浩特重鎮，殲滅噶爾丹一萬餘名留守軍隊。待至六月，清軍在昭莫多會師，激戰一日方攻下這座要寨。盤查俘虜時，方知噶爾丹先是派人與戈羅文聯絡，羅刹見他已無用處，不但不肯收留，連原已答應的一千枝火槍也拒不交付；與回部、青海聯絡，信使一去杳如黃鶴。城中降將隻說噶爾丹由他的女兒護送，十日前就棄城而走，誰也不知他逃往何方。
得悉這一情況，康熙立即在昭莫多的喇嘛廟中召集軍事會議。恰這時留守北京的佟國維奉皇太子胤礽命遞來飛折，說回部、青海、哈薩克等部都己修表朝廷，叛離噶爾丹，稱臣進貢，保證噶爾丹一人境，即刻擒拿解送北京。康熙一合計：此刻噶爾丹彆無路走，隻有投靠**喇嘛桑結仁錯。
“真的如此，那就麻煩了。”康熙想到自己十餘年的準備，真有點欲哭無淚，一旁的佟國維等跪請康熙回京。
康熙隨意翻動著北京遞來的一疊奏折，足足幾十件，都是各部院大臣請駕回鑾的。有的說：“蠻夷荒服，治以不治，古惟有驅逐之而已，防守之而已。”有的說：“勞師遠征，未必能奏效也。”康熙看著輕蔑地冷笑一聲，將文件一推，對費揚古等人道：“打起精神來！青海回部既入我手，噶爾丹想去藏北談何容易！朕看他此刻頂多逃往塔米爾河一帶。隻要藏兵不能和他會合，一定能捉往他。現在還不能說功虧一簣，若真的放虎歸山，數年之後就又要變成西域一大毒瘤！”費揚古等人看了看康熙，康熙的臉繃得緊緊的，石頭人一樣不動聲色。費揚古等人心下又愧又佩服，遂叩頭說道：“使聖心勞苦如此，臣等萬死不能辭咎！既然皇上決心已定，臣等何敢畏難？”
康熙一擊案站起身來，目中放出咄咄逼人的光，略一思忖，至案前提筆疾書寫道：
大將征袴膽氣豪，冰矛青劍霜刃刀。
待到天兵凱旋日，親與將軍脫戰袍！
看了看，中間有兩個“將”字，似有不妥，也不細推敲，將墨汁淋漓的紙遞給費揚古道：“這個賜你！你還是率軍由北路包抄，朕率中軍督戰！今日即召三軍千總以上官佐，朕親自訓誡，不達目的，誓不罷休！”
費揚古抖著手接過詩，熱淚像泉水般湧流出來。
大軍又進發了，費揚古等人按照康熙帝的部署，設伏用計，前後夾擊，噶爾丹殘餘部死的死，降的降，還擊斃噶爾丹之妻阿奴，最後，噶爾丹隻帶了幾十名騎兵脫逃。
康熙三十五年，六月中旬大軍凱旋。