就在海匪還在懵逼之時，廖泥鰍已指揮船隻將另一側舷對準了海匪船隻。第二輪炮擊過後，水匪船隻徹底亂了套，有的橫停在原地，有的開始掉轉船頭準備逃跑，還有兩艘小船燃燒了大火。看到海匪船隻起火廖泥鰍急了，在他眼裡那些海匪已經是礦洞中的免費勞力，那些船隻也是霹靂軍的資產。如今看到即將到手的船隻正在熊熊燃燒，如何不心痛？當下他便命令各船圍了上去。
小半晌過後，一半的海匪船隻被霹靂軍俘獲，剩餘的大部分退回了基隆港，隻有幾艘小船仗著輕快逃出了包圍圈，四散而去。廖泥鰍也沒有派船追趕，一方麵是這些海匪熟知周邊海況，隨意尋了地方便可躲藏起來；另一方麵霹靂軍的目標是基隆港，萬不可撿了芝麻卻丟了西瓜。至於那些逃跑的海匪以後有的是機會收拾，他們不敢前往大陸沿海自投羅網，更不敢冒險駕駛小船前往北方的倭國、高麗，或者前往南方的交趾或呂宋。這流求周邊海域風高浪急，一個大浪便會讓輕快小船傾覆，船上的人也會葬身魚腹。
兵貴神速，廖泥鰍率軍直撲基隆港。海匪的木頭寨門和柵欄那些經得起火炮的轟擊，一輪炮擊之後便土崩瓦解。隻不過這些海匪十分頑固，紛紛躲在了寨中角落處，對霹靂軍的勸降喊話充耳不聞。廖泥鰍舍不得轟壞寨內房屋，隻得派兵進入寨中進行巷戰。此次遠征基隆，霹靂軍共出動了八百人，其中包括五百水軍和三百步軍，可謂是精銳儘出，這也是廖泥鰍一戰而下的信心，畢竟據情報海匪不過四五百人，大小船隻也不足百艘，而且是中小船隻居多。
海匪之所以拒不投降，便是想憑著巷戰翻盤。這些海匪長年乾著刀口舔血的營生，跳幫作戰是其強項，尤其擅長近身格鬥，甚至可以輕鬆戰勝人數相等的官軍水軍。海匪頭目及其親衛隊還裝備著倭刀和海鮫皮甲，傳承自唐刀的倭刀極為鋒利，是單兵格鬥的利器，甚至可以將人體劈成兩半。海鮫皮甲則是成年海鮫的皮經過反複鞣製而成，光滑堅韌，可以滑開彎刀劈砍和尖刃刺擊。海匪頭目相信憑著精良武器和主場優勢，定讓這群來曆不明者铩羽而歸。
隻不過這些海匪不知道的是，時代已經變了。上岸的霹靂軍以班為單位，有人在前排持盾掩護，有人在後排用火槍射擊。海匪衝出屋子則會麵對長矛的攢刺和彈雨的洗禮，躲在屋中則會被扔進來的手雷殺傷。要說官軍水軍也裝備了火器，可那些火器煙霧和聲響大，殺傷力卻低下。而當下這些進攻者手中火器的威力遠超出了他們想像，就連匪首及其親衛隊，也在一陣爆豆般的聲響後全部倒仆在地。以往刀槍不入的海鮫皮甲也被擊得滿是窟窿眼，血水混合著氣泡，正汩汩從軀體上冒出。
眼見對方勢不可擋，又見匪首已死，其餘海匪便紛紛投降了。