少年偵探團再次給柯南製造了比黑衣組織更危險的局麵。黑衣組織雖然強大，但他們可怕的是犯罪計劃，但隻要有計劃，柯南就有把握抽絲剝繭。
而少年偵探團的可怕在於不可測，根本不知道這幾個熊孩子會乾什麼，就算是大偵探也無可奈何，也會因為不可控因素而措手不及。
組織的陰謀計劃雖然可怕，雖然破壞性十足，但隻要有計劃就有破綻，加上柯南還有fbi、公安、軍情六處的隊友協助，也不怕這些陰謀詭計。
但對少年偵探團的不可測性，柯南總是從主動掉入被動，總是無可奈何地陷入危險。
這次真的是要多謝灰原哀了，她撿起了罪犯的手槍，並且開槍為柯南解圍，解救了少年偵探團。
通過這件事情，灰原哀也確定了柯南就是工藤新一沒跑了。
少年偵探團的家長得知孩子破了一個假鈔案，都很高興。絲毫不考慮孩子們要是陷入危險怎麼辦，這次罪犯可是有槍的。
目暮警官都無語了。
柯南決定送灰原回家，卻發現這不是朝自己家的方向走麼？
“工藤新一，你果然沒死。”灰原哀突然開口，把柯南嚇了一跳。
“你是誰？”柯南很緊張。
“你不用擔心，有件事情我要告訴你。那就是關於阿笠博士的，他是黑衣組織的人，我想他從很久以前就一直在關注你這個警視廳的救世主了。”灰原說這些沒有證據，隻有直覺。但她相信自己的直覺，隻要黑衣組織成員接近自己，她的直覺雷達肯定會做出反應，百試百靈。
所以她確定阿笠博士肯定也是組織的人。
“不可能。”他們和阿笠博士做了幾十年鄰居，說道：“他是看著我長大的，不可能是組織的人。”
“以前或許不是，但組織神通廣大，可以殺死博士取而代之。”灰原冷冷地說道：“你難道沒察覺博士變了麼？”
柯南沉默了，確實變了很多，以前博士一直穿白衣服，現在換成了黑色。而且以前的博士也是法派的支持者，現在卻總是說一些非法派的言論，變化不少。
難道阿笠博士真的被害死了，現在的博士是假的？
“可是如果這個博士是假的，他知道我是工藤新一，為什麼不出手？”柯南問道。
“或許是要觀察你這個實驗對象吧。本來我認為隻有我一個人知道你還活著，看來我太小看組織了。”灰原哀說道。
“所以你到底是誰？”
“我叫做宮野誌保，是組織的研究員，你吃下的藥劑就是我改良的。在發現你的秘密之後，我也吃下了藥，從組織逃了出來。”
柯南明白了對方是組織的叛徒，吃了藥，返老還童了。那麼她說的話就有一定的可信度了，難道博士真的已經被取而代之了？想到這裡，他是徹底不好了，得想辦法確定博士的身份。同時他感覺很無奈，因為身邊的人總是出事。