深海獵人的強大有目共睹，換成是普通的阿戈爾人讓他們以獵人們的作戰條件上戰場，恐怕連怎麼死的都不知道，在不使用武器的情況下，深海獵人無疑就是一支無敵的軍隊，連海怪都對他們束手無策。
但一個非常嚴重的問題始終困擾著深海獵人——海嗣化。
深海獵人獲得海嗣血脈的同時也注定會深受其影響，就像一萬年前的阿戈爾人擔憂的那樣，深海之力的使用將會大幅度加速阿戈爾人海嗣化的進程，如果預想沒有錯誤的話，這些深海獵人的結局除了戰死就隻剩下了變成海嗣這一條途徑。
也就是說，深海獵人是一個定時炸彈，執政院無法把控這個炸彈什麼時候會炸掉。
一開始，深海獵人海嗣化的問題還沒有那麼明顯，但隨著時間的推移和戰鬥次數的增加，越來越多的深海獵人有了海嗣化的跡象，並且軍團裡已經有出現獵人變成海嗣屠殺同胞的事發生，歌蕾蒂婭儘力封鎖消息，避免透露風聲影響士氣，但瞞得過獵人卻瞞不過執政院。
作為對抗海嗣和深海之神而人工創造出來的產物，現在反而被發現最終會變成新的海嗣而成為阿戈爾的敵人，一時間，執政院內七嘴八舌，他們在激烈爭論著該如何應對這支隊伍。
在當時，執政院內部對深海獵人的觀點非常矛盾，不管是建構派還是原初派，接納亦或是處置深海獵人的聲音都存在，但在當時，兩派裡各自人數最多的中間派一致認為，為了阿戈爾未來的穩定，應該處置深海獵人。
建構派認為，深海獵人雖然是個很好用的武器，但存在反噬的風險，在建構派的堅持下，執政院又設立巡海者守衛實時監控深海獵人，一旦深海獵人出現變異跡象，可以直接將其抹殺。
諷刺的是，巡海者守衛也是接受了海嗣血脈改造的阿戈爾人，但由於不用像深海獵人那樣經常奔赴戰場，因此他們的海嗣化進程遠遠慢於深海獵人。
至於深海獵人被抹殺後阿戈爾又該怎麼辦，建構派的建議是繼續進行人體實驗製造新的一批深海獵人，當他們也走向海嗣化後又將其抹殺掉，再周而複始，深海獵人被當做了周期性替換的工具。
而原初派的想法則簡單得多，由於深海獵人幾乎全都是蓋密爾人出身，從意識形態上來講就屬於原初派的政敵，建構派憑借著深海獵人的功績在執政院裡鞏固了領導地位，原初派無法接受深海獵人這個組織。
對應的是，在當時，深海獵人也很看不起執政院內隻會製造內部矛盾卻對這場戰爭難有作為的原初派，原初派對戰爭的態度非常消極，他們認為這場災難總會過去，就像之前的兩次一樣，阿戈爾需要做的隻是防禦就好了，根本沒有必要發起反擊，雙方常常在戰術規劃上有諸多矛盾。
更令深海獵人感到無法理解的是，原初派認為神無法死去，但又認為在這場戰爭中萬萬不可以擊殺神，因為他們認為如若神死去很可能會動搖深海之力的根基，影響阿戈爾的發展，即便現在的事實已經證明了神的蘇醒早就改變了深海之力的屬性。
總之，在當時，無論是哪一個派彆，他們對深海獵人都很不滿意，後方悠哉遊哉的執政官們卻在瘋狂拉前方奮勇殺敵戰士們的後腿。
深海獵人也感受到了來自執政院的惡意，雖然作為執政官的歌蕾蒂婭在儘力安撫雙方的矛盾，但終究無法釋懷，到後來，連歌蕾蒂婭和執政院都已經失去了彼此之間的耐心。
最終，經曆了多年的征戰，深海獵人軍團已經飽受摧殘，絕大多數獵人們要麼戰死，要麼變成海嗣而被巡海者守衛處死，原本一個軍團的兵力現在已經剩下不到一個支隊，而剩下的這些人也大都到了海嗣化的中後期，非常危險。
執政院認為，深海獵人勞苦功高，他們為阿戈爾奉獻了他們的一生，是阿戈爾的驕傲，並且一致決定，將剩下的深海獵人全部送上死路，這是作為他們功績的回報。
在一次探測行動中，執政院檢測到了神的蹤跡，並將所有的深海獵人全部派往神的居所，這場刺殺深海之神的行動，也是執政院為了一次性處理掉全部深海獵人，而設計的自殺計劃。
深海之神不可戰勝，這是當時阿戈爾兩派的主流共同觀點，這個計劃完全是為了人為銷毀掉深海獵人這個失敗的產物，並防止他們落入敵手而設計的。
包括歌蕾蒂婭在內的一些深海獵人也深知執政院的用意，但他們還是義無反顧地選擇了保護他們的人民，衝向他們的敵人，雖然他們所保護的人，正是將他們送上死路的劊子手。
在此之後的一段時間裡，執政院為了防止這個技術的真相暴露，將此技術的信息視作禁忌給徹底封鎖，連同深海獵人的消息也被封鎖，在執政院的輿論操控下，曾經在大名鼎鼎的深海獵人軍團，也逐漸銷聲匿跡。
但執政院沒有想到的是，深海獵人並沒有全部喪生，強大的體質讓他們即便經曆了那麼慘烈的戰鬥後依舊活了下來，而且還不止一人。
並且令人更加驚訝的是，雖然現在依舊不清楚原因，但他們竟然做到了讓深海之神再度陷入沉睡，戰爭竟然就這麼突然結束了。