然而，桓大司馬為了確保糧食物資的充足，在坊頭駐足不前，休整兵馬補充物資花了十多天的時間。正是這寶貴的十多天時間，給了燕國啟用慕容垂率軍抵禦的機會。
當桓大司馬終於開始派前鋒兵馬進軍鄴城的時候，他們遭到了慕容垂的阻擊。連續幾場小規模的戰鬥，都以北伐大軍的失敗而告終。桓溫這時候才意識到，遇到了強勁的對手。當他得知前方領軍的是慕容垂的時候，桓溫知道，接下來的戰鬥怕不是那麼容易便能得手了。燕國慕容垂之名，不僅在北方的大地上傳揚，大晉也同樣知道他的威名。
但是，桓溫沒有退縮，此次北伐，他的目標就是要攻下鄴城，滅了燕國。作為大晉如今權勢熏天的人物，他的聲望和實力已經到達了頂峰。此次他以北伐為名，征召了徐兗兩州郗氏的兵馬，以及豫州袁真的兵馬。這兩處兵馬正是在他掌控之外的兵力。是他夢寐以求想要拿到手的兵權。
桓氏家族如今已經掌握了荊州揚州江州的兵馬，唯一需要忌憚的便是豫州和徐兗兩州的兵馬成為他想要成大事的阻礙。此次北伐正是乘機調動和攫取豫州和徐兗兩州軍事的一個契機。
隻需要攻克鄴城，滅了燕國。桓氏的聲望便足以碾壓司馬氏皇族。到
那時，荊揚江豫徐兗六州軍事在手，又挾滅燕國之威，大晉朝還有誰能夠和自己比肩？司馬氏但凡有一點自知之明，便當主動讓賢。
所以，桓大司馬決定和同慕容垂進行一場真正的較量。之前的幾次小的交鋒雖然失利，但算不得什麼。主力大軍作戰的勝敗才能定局。
然而，就在桓溫整軍準備大舉進攻的時候，又一件事令他措手不及。
入秋以來，來時從汶水清水再到黃河這條水路水位迅速降低，運送補給的船隻已經不能從這條水路通行了。秋旱打亂了一切的計劃，糧草物資通道的斷開讓北伐大軍陷入了一個尷尬的境地。
大軍每天消耗的糧草物資是巨量的，軍中屯糧雖有，但是一旦後續斷絕，支撐不了多久便會導致嚴重的後果。和慕容垂的大戰不可能在數日內結束，若對方退入鄴城之中防守，那恐怕需要更長的時間才能攻下。
糧食物資的補給，便成了一個不得不解決的問題。
桓溫有備用方案，他當即命人傳令豫州袁真的兵馬，令他進占位於西南方向的石門。隻要占領石門，便可以開鑿河道，連通睢水和黃河之間的水路，這條水路寬闊，大船可以通行，便可解決眼前的難題。
於是乎，桓溫率領主力兵馬不得不在黃河岸邊和慕容垂的兵馬繼續對峙。雙方都忌憚對手，都不敢貿然進攻。小的戰鬥雖時有發生，但全麵作戰卻都謹慎之極。
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北伐軍在等石門被占領，河道被連通的那一刻。而慕容垂從來不是一個冒進的人，他知道此戰乾係燕國存亡，自然不可能貿然主動進攻。他更明白以逸待勞，時間拖得越久，對自己越有利的道理。況且，他已經知道了晉朝兵馬現在的尷尬處境。他決定讓桓溫陷入絕境之中。
慕容垂下令他最小的弟弟慕容德率領一萬騎兵抵達了石門，袁真的豫州兵馬抵達石門之後，慕容德發動了突襲。雙方在石門大戰，袁真雖然占據石門，但是在慕容德的不斷襲擾之下，根本沒有辦法開通河道。
而在正麵上，慕容垂也並不進攻，隻嚴陣以待，和桓溫繼續對峙。
大燕的戰神果然名不虛傳，他仿佛為了領軍作戰而生一般，在戰場上，他的每一個行動都符合作戰之道。他既不冒進，又不膽怯，做出的決策直擊對方要害，令對手痛苦不已。
桓大司馬終於意識到問題的嚴重性了。二十多天過去，石門水道未開，軍糧即將耗儘。而更可怕的是，他得到了來自秦國邊境的稟報。
秦人已經出兵了！