最初寶劍騎士團的全名為“寶劍利沃尼亞兄弟騎士團”。組織架構完從上至下共分為二個等級。
第一級：貴族騎士，由參與殖民的各德意誌貴族組成，每名騎士轄下數十名武裝侍從；
第二級：普通侍從，包括效忠騎士團的民兵，以及服侍貴族的見習騎士和扈從。
這其中，作為騎士團之首的無疑是“寶劍騎士大團長”，擁有整個騎士團的最高權威，即是軍隊的總司令，又是最高行政長官。其次便是副團長、主帥、區隊長、騎士等下級騎士軍官。
不過有一點值得注意，由於寶劍騎士團是主教阿爾伯特一手組建的，所以教皇同意阿爾伯特獨立指揮騎士團，也就是說，寶劍騎士團需要聽命於主教阿爾伯特，這與其他騎士團直接聽命教皇不同，所以其地位自然不如三大騎士團。
隨著寶劍騎士團到處征戰，周圍的土著勢力自然十分敵視這幫騎士。公元1217年，愛沙尼亞人聯合羅斯人發動反擊，一支約6000人馬的聯軍攻入了利沃尼亞。時任大團長的沃爾金當機立斷，率領人數處於劣勢的3000騎士團主動迎戰。
雙方會戰於菲林森林地區。
兩軍布陣，寶劍騎士團以重甲騎士居中，以本土仆從為兩翼，擺出決一死戰架勢。相比之下愛沙尼亞軍成分混雜，顯得淩亂不堪。
果然，在雙方正式交戰中，寶劍騎士團更像職業軍團，而愛沙尼亞聯軍則如同匆忙上陣的民兵，鏖戰不久，寶劍騎士團左翼率先突破右翼斬殺敵軍指揮官。
此後數十年裡，寶劍騎士團越戰越勇，他們憑借自身優秀的戰鬥素養，以及來周圍勢力的增援，不斷周旋於教皇、丹麥、德意誌、羅斯等國之間，拉一派打一派。