然而此時明貴州巡撫：江東之，下令明永寧衛指揮使：楊國柱，率3千明軍進剿楊應龍但兵敗被殺！
隨後明神宗罷免了江東之以明都察院右副都禦史：郭子章，代替又起用了明都察院右僉都禦史：李化龍，為兵部右侍郎節製四川承宣布政司、湖廣承宣布政司、貴州承宣布政司三地兵事，並調明四川總兵：劉綎、明大同總兵：麻貴、明廣東都指揮僉事：陳璘、明薊州總兵：董一元，南征眾將在明湖廣川貴總督：李化龍，的指揮下明軍分兵八路進攻每路3萬人。
明四川總兵進軍綦江縣連破楠木山和羊簡台、三峒天險又打敗楊朝棟所統的苗軍，而巾幗英雄：秦良玉，與丈夫明石柱宣撫使：馬千乘，率兵攻下金築七寨同酉陽土司軍一起攻下桑木關為南川路戰功第一，其他幾路明軍也都取得勝利。
接著明四川總兵又攻占婁山關而楊應龍率苗軍決一死戰又敗，這時明四川總兵占天險之地龍爪屯、海雲屯、海龍囤與各路明軍合圍，又破大城縣而楊應龍知道大勢已去，便與妻妾自殺相繼自殺，楊朝棟則被俘明軍入城〖播州之亂〗被平定，到此萬曆三大征結束。
此刻住在河南承宣布政司開封府汜水縣會客樓的吳俊振，聽完馬維的講述之後吳俊振點起了房中的蠟燭，他繼續問道“那後來建奴又是怎樣反我大明的呢？”
於是馬維又繼續介紹下去在明萬曆三十四年公元1606年再次上任的明遼東總兵：李成梁，因守不住東邊建州八部之一董鄂部放牧地的寬甸六堡，故此下令放棄六堡將八百裡地內遷那裡的六萬戶百姓入撫順守禦千戶所，又命令遼東明軍後退三十裡！
此舉被明兵科給事中：宋一韓，與明都察院禦史大夫：熊廷弼，兩人得知立刻上奏彈劾並大罵明遼東總兵，但明神宗覺得李家為大明儘職儘責還是支持明遼東總兵的做法，幸虧女真族各部有才能的首領全部死去，不然入侵撫順守禦千戶所是必然的事，不過佟努爾哈赤也趁機把勢力擴張到了明軍防線，並借此機會又去京城朝貢大明天子表示守衛邊疆的忠心。
明萬曆三十五年公元1607年佟努爾哈赤借機討好明遼東總兵，並以輝發女真貝勒：納拉·拜音達理，兵助葉赫以及聘我二女：佟嫩哲，而不娶為由親自帶兵征討輝發女真部。
然而明建州左衛參將：鈕祜祿·額亦都，向佟努爾哈赤稟報道“女真語：啟稟貝勒爺那輝發部首府在地勢險要的扈爾奇山城，又經拜音達理加固城牆易守難攻！若我建州大軍一動可能他輝發軍必然加強戒備閉門堅守強行？攻城雖然可以取勝但傷亡必然多，倒不如先派出幾十名武士化裝成輝發部人潛入城中，在裡應外合那麼扈爾奇山城可一鼓作氣拿下。”
此舉被佟努爾哈赤同意了，隨後佟努爾哈赤率1萬建州軍離開赫圖阿拉城，開始包圍了輝發首府〈扈爾奇山城〉已在城外守候兩天的明建州左衛參將來到佟努爾哈赤大帳內說道“女真語：伏兵已進城二日，各項工作已完成可以攻城了。”
於是建州大軍攻入城內滅了輝發女真部，在班師回去時又遇東海女真瓦爾喀部蜚悠城主：台楚嚕·策穆特黑，前來投降建州女真並說道“女真語：我在投奔烏拉女真部後，屢次遭到烏拉貝勒：納拉·布占泰，的羞辱希望可以歸附建州女真三衛？”
佟努爾哈赤就命令明建州右衛指揮使：舒爾哈齊、佟努爾哈赤長子明建州左衛指揮同知：佟褚英、次子建州左衛指揮僉事：佟代善、以及明建州衛指揮同知：瓜爾佳·費英東、明建州衛指揮僉事：佟佳·扈爾漢、明建州衛鎮撫：舒穆祿·揚古利，等將領率3千建州女真兵即刻趕至蜚悠城收服部眾。
烏拉女真貝勒得知消息後就派叔叔：納拉·博克多，率1萬2千烏拉兵前往截擊因明建州右衛指揮使與烏拉貝勒有姻親關係，所以與明建州右衛參將：郭絡祿·常書、明建州右衛遊擊：瓜爾佳·納齊布，停在山上按兵觀望。