怎奈不明情況的李氏朝鮮尚慶左道兵馬節度使：金應瑞，就直接上報給李氏朝鮮都元帥：權栗，而李氏朝鮮都元帥又上報李氏朝鮮宣祖昭敬郡王河城大君：李昖，使得李氏朝鮮郡王當即就命令李氏朝鮮三道水軍統製使：李舜臣，準備迎敵。
但他卻懷疑其中有詐，一直徘徊不出。
10月22日，明神宗：朱翊鈞，派大批宦官為稅使，到各地征稅，專供內廷揮霍之用，先命明禦馬監左監丞：張燁，前往北直隸順天府通州右衛張家灣征收租稅，給以關防，規定每年征取白銀四千兩，分為四季並且按季解進。
不久又命明神宮監管理太監：王朝督，征天津衛、天津左衛、天津右衛，從此與礦監之禍並為榨取民膏民脂的稅法之禍由此開始。
自是二三年間稅使四出，多兼領礦，許多人集礦監、稅使一身，到處橫行勒索，貪奸無比，民益不堪怨聲載道，群臣分分屢諫，但明神宗卻無動於衷。
明萬曆二十五年公元1597年正月20日，幕府關白：豐臣秀吉，在弄清楚事情的來龍去脈之後，以李氏朝鮮王國不來謝罪為借口宣告（明、幕）和談破裂！並派遣了陸軍十四萬戰船數百艘，第二次入侵李氏朝鮮王國，史稱［丁酉倭亂］。
正月21日，李氏朝鮮都元帥至尚慶右道閒山島，對李氏朝鮮三道水軍統製使說道“朝鮮語；加藤清正馬上就要來了，水師要按照時羅的約定出動，千萬不要錯過戰機！”
但在李氏朝鮮都元帥返回後的第二天，李氏朝鮮郡王就得知幕府第二軍右副將：加藤清正，已於正月15日抵達李氏朝鮮王國尚慶右道長門浦。
這讓李氏朝鮮郡王震怒，他召群臣罵道“朝鮮語：倭酋（小西行長）如示諸掌而指教之，我國不能為之，我國誠天下庸劣國也！今者舜臣豈望擒馘清正之首哉？隻揚舲耀武，沿洄洋路，而終不得為，誠可歎也！”
同時認為李氏朝鮮三道水軍統製使長期慣於欺君，武臣輕慢朝廷之習，不可不治，所以決定嚴懲李舜臣。
正月25日，李氏朝鮮郡王遣使向大明帝國求援。
2月初5日，大明朝廷遂召集各官議論李氏朝鮮王國的戰局形勢，並分析了倭軍的動向，到了2月11日朝廷再議援朝事宜，決定調遣萬全都指揮使司宣府鎮、山西行都指揮使司大同府和北直隸薊州鎮、遼東都指揮使司的軍隊七千人，還招募了浙兵三千七百人，並詔令李氏朝鮮王國設立海防司道官。
2月11日，李氏朝鮮三道水軍統製使：李舜臣，被扣上了「欺罔朝廷、縱賊不討」之罪下獄，取而代之的是李氏尚慶右道水軍節度使：元均，統製三軍。
2月15日，明神宗開始任命原明延綏總鎮總兵兼都督同知：麻貴，為「備倭總兵」統帥南北諸軍出師李氏朝鮮王國，征剿幕府侵略軍。
3月15日，明神宗升明山東布政司右參政：楊鎬，為「都察院右僉都禦史」經略李氏朝鮮王國軍務，為了加強後援，支持明都察院右僉都禦史：楊鎬，經理李氏朝鮮王國的軍務。
緊接著又命明兵部左侍郎：邢玠，為［兵部尚書兼右副都禦史］總督薊州鎮、遼東都指揮使司、保定府大寧都指揮使司的軍務兼理糧餉，並且經略禦倭。
然而明都察院右僉都禦史還未至，就先上奏十事，其中有令李氏朝鮮王國官民輸粟，得增秩、授官、贖罪，以及鄉吏丁夫等免役。
又以李氏朝鮮王國君臣隱匿錢糧，不餉援朝明軍，劾奏其罪，因此李氏朝鮮王國官民們多怨楊禦史。
這時李舜臣在獄中遭到嚴刑拷打，可能有性命之憂！
為此李氏朝鮮知中樞府事：鄭琢，就上了一道《伸救箚》曆數李舜臣的功勞，為李舜臣辯護，還請求李氏朝鮮郡王開恩特赦。
才讓李氏朝鮮郡王同意免李舜臣一死，並讓他再度白衣從軍，時為明萬曆二十五年公元1597年、宣祖三十年4月初1日，但是此前李舜臣的老母：卞氏，便得知了李舜臣入獄，憂慮成疾不久逝世。
4月13日，李舜臣聽說母親去世的噩耗，連忙趕回牙山奔喪，他悲痛地說道“朝鮮語：欲忠於國而罪已至，欲孝於親而親亦亡！”
隨在牙山待了三天後，就辭彆母親靈筵，繼續在李氏朝鮮都元帥：權栗，的麾下白衣從軍，來尚慶右道草溪服役。
而李氏朝鮮都元帥下令趁倭軍初到，立足未穩，讓李氏朝鮮三道水軍統製使率所部李氏朝鮮海軍攻擊尚慶左道慶州府釜山浦，打算全殲幕府全部海軍力量！
6月19日，李氏朝鮮三道水軍統製使艦隊從尚慶右道閒山島出發，向東開進，半路上，遇到了幕府左近衛中將：島津義弘，和幕府民部少輔：高橋統增，部下的小股巡邏艦隊，隻經過短暫的交火，李氏朝鮮三道水軍統製使即下令全軍撤回大本營。
結果首次攻擊無功而返。