不久倭軍全線撤退至尚慶左道慶州府釜山浦，而明軍阻滯倭軍攻勢，為大明帝國增兵李氏朝鮮王國贏得了時間，戰略目的完美實現。是役明軍傷亡兩百餘人，倭軍傷亡六百餘人。
隨後明薊遼總督：邢玠，還派明廣東都指揮僉事：陳璘，在忠清左道青山縣夾擊斬殺倭軍5千人獲得小勝，史稱（青山大捷）但倭軍卻閉城不出堅守待援被明軍圍困十日卻不能克！倭軍則以詐降為緩兵之計拖住明軍。
另一邊前任明播州宣慰使：楊應龍，又繼續攻占了四川承宣布政使司重慶府江津縣、南川縣、瀘州合江縣，貴州承宣布政使司銅仁府洪頭屯、高平屯、新村屯，以及侵略湖廣承宣布政使司保靖州宣慰使司、辰州府總共48屯地區，惹得地方官府震驚，朝廷震怒。
10月17日，明神宗：朱翊鈞，授封安南黎世宗：黎惟潭，為（大明安南都統使）使得安南政權又從莫氏轉入黎氏。
另外明建州左衛軍民指揮使：愛新覺羅·努爾哈赤（佟·努爾哈赤）還與葉赫女真部西城貝勒：納拉·布楊古、葉赫女真部東城貝勒：納拉·金台吉，聯姻椎牛刑馬為盟，逐步孤立了哈達女真部和輝發女真部。
為了隱瞞朝廷自己勢力擴大的消息，明建州左衛軍民指揮使決定第四次入京城去朝貢大明帝國。
而這次明建州左衛軍民鎮撫使：愛新覺羅·舒爾哈齊，也一起前來，是他第二次入京朝貢，也更助長了他的野心。
在到達京城之後兩人都受到了朝廷隆重接待，並賞賜了許多的金銀綢緞，其中明建州左衛軍民指揮使在得知朝廷又一次發兵抗倭時，明建州左衛軍民指揮使大義凜然提出發兵支持。
但這次依舊被明神宗，給好言相勸拒絕了，看在他的忠心份上已經鎮守遼東都指揮使司女真各部需要兵力，便賜封他為「龍虎將軍」賞〈尚方寶劍〉。
而朝中官員有些擔心建州左衛軍民指揮使司做大？又加上建州右衛軍民指揮使司與建州衛軍民指揮使司暫無人管理！
於是明神宗為了製約明建州左衛軍民指揮使，便授封明建州左衛軍民鎮撫使為「建州右衛軍民指揮使」來做為一種戰略對策，也算是儘力拉攏和收買效忠於大明帝國之人。
此事被明建州左衛軍民指揮使看在眼裡、恨在心裡，兩者間的矛盾瞬間激化。
不過明建州右衛軍民指揮使：愛新覺羅·舒爾哈齊，卻是非常的感激大明帝國恩寵，他決定誓死捍衛大明帝國，除了積極與大明發展密切關係之外，他還通過聯姻把二女兒：愛新覺羅·額恩哲，嫁給明寧遠伯：李成梁，次子明東征右副總兵：李如柏，為妾加強聯係。
並且利用姻親關係，與其它女真部落炫耀，用來擴大他個人的實力。
10月11日，明備倭總兵：麻貴，以明禦倭總兵：李如梅，率領數千人攻向尚慶右道星州牧穀城，幕府從四位下築後守：小早川秀包、幕府築後三池：築紫廣門，負責死守城池。
但由於明軍猛烈攻勢，再加上探哨來報援軍到達，之後兩人商議決定趁夜突圍去迎接幕府岡山藩左衛門督：小早川秀秋，派出的援軍幕府從五位下玄藩頭：山口正弘、幕府兵庫頭：南部無右衛門，彙合後轉守為攻，重創明軍。
使得明禦倭總兵遂下令退去，因此被革職查辦。
同時攻打忠清左道青山縣的幕府第八軍右軍大將兼長府藩藩主：毛利秀元，等倭將則被明沈陽中衛左參將：彭友德、明沈陽中衛鎮撫使：柴登科，率領的明、朝聯軍重兵包圍死傷慘重。
怎奈從尚慶左道蔚山都護府出來了，幕府從五位下左京大夫：淺野幸長、幕府河內守：宍戶元續、幕府豐後國藩主：太田一吉，等倭軍將領接應，並掩護他們撤退。
10月26日，幕府倭軍水師第一軍伊勢津藩主：藤堂高虎，率領133餘艘戰船出發，欲趁漲潮時攻進鳴梁海峽，全殲李氏朝鮮水師。
結果李氏朝鮮三道水軍統製使：李舜臣，首先將海峽內的民用船隻僑裝成戰艦，以此來擾亂倭軍，使其以為李氏朝鮮水師船隊已經恢複過來。
他自己則親率14艘戰船引敵深入鳴梁海峽，在成功引誘倭軍進攻後，李氏朝鮮三道水軍統製使隨即便發起了集中的攻擊，對準倭軍指揮艦攻去，結果殲滅了倭軍指揮艦和其他戰船2艘，並擊斃幕府第四軍水師河野家督大名：來島通總。
同時間潮水開始退卻，李氏朝鮮船隻趁勢進攻，倭軍船隻卻因失去主帥，軍心散渙，隻得順潮向東撤退，但卻遇上了李氏朝鮮三道水軍統製使事先埋下的鐵索和木樁，使其無法退卻。