明萬曆三十三年公元1605年，尼德蘭王國（荷蘭）何屬東印度公司入侵大明帝國福建承宣布政使司台灣府澎湖巡檢司，並伐木建房還派大明商人：李錦、郭震，向地方官上報大明天子準備通商的消息。
當即被拒絕，明福建總鎮巡撫兼都察院右僉都禦史：徐學聚，下令禁止漁民下海，斷了尼德蘭人經濟，導致尼德蘭人被迫撤走，之後又反攻台灣府奪取了澎湖巡檢司開始設防。
4月27日，明神宗命明通政司右通政：陳子貞，等十二人為正使、明中書舍人：莊元臣，等十二人為副使，冊封周王係宗人：朱在錝，為奉新郡王、朱勤煘，為義陽郡王、朱在壑，為安吉康和郡王。
冊封益王係宗人：朱由棅，為安仁郡王，冊封榮王係宗人：朱載珁，為貴溪郡王，冊封魯王係宗人：朱壽鍈，為東原郡王、朱以浩，為安丘郡王、朱壽碒，為鄒平郡王。
冊封楚王係宗人：朱盛浮，為通城郡王，冊封蜀王係宗人：朱奉?，為南川郡王，冊封沈王係宗人：朱效鑍，為保定郡王、朱效鋞，為沁水郡王。
冊封秦王係宗人：朱誼侃，為永壽康裕郡王，冊封晉王係宗人：朱敏淴，為河東郡王，冊封遼王係宗人：朱術?，為蘄水郡王。
此時陝西行都指揮使司的明軍警報響起，邊界已經有5年沒打仗了，由漠南蒙古土默特部首領：銀定，和漠南蒙古西土默特部首領：歹成，一起發兵攻打大明帝國陝西行都指揮使司鎮番衛被明陝西總鎮總兵兼陝西都指揮僉事：柴國柱，打敗退去。
9月25日申時，京師發生小規模地震，自東北向西南行，連震二次。
此時京軍三大營官軍前往京師內城盔甲廠領取盔甲火藥，而監放火藥的明兵仗局掌印太監：臧朝、明提督軍器庫太監：王才，因壇內舊火藥已結成硬塊，不便分發！
就命令工匠用鐵斧劈開，結果造成爆炸，聲若雷霆，火槍、火箭進射百步之外，燒死明兵仗局掌印太監以及明五軍營把總：傅鐘，等十人、明神機營把司：李仲保，等八十三人。
其局內工匠人等並街市經過居民死傷者多不可稽，焚毀明時坊五處！
11月14日，明皇太子才人：王瑤英，成功誕下明皇長孫：朱由校，但其地位卻依舊不受待見！
12月初1日，自萬曆二十四年設礦監稅使以來，廷臣們上疏諫阻者不下百餘次，但明神宗俱不聽，以致於礦監稅使四出，大肆虐民，流毒全國，結果是民窮財竭，各地騷動暴亂。
而萬曆二十五年至萬曆三十三年近十年間，各礦監所進礦銀不足三百萬兩，至於不計其數的金珠、寶玩、貂皮、名馬則俱為大明天子所有。
導致內閣大臣們再次極論礦稅害民狀，又言“開礦破壞天下名山大川，儘傷靈氣，恐對陛下身體大為不利，隻有急停開礦，靈氣才能恢複。”
為此明神宗於12月初2日，下詔罷天下礦稅，以稅務歸有司，以歲輸所入的一半歸於內府，另一半歸戶、工二部，時稱“停礦分稅”。
然而礦監稅使們卻並沒有撤回來，其害一直延續到明神宗病死，方告結束。
明萬曆三十四年公元1606年正月24日，由於明神宗下詔罷免全國礦稅，所以遭到平時獲利的礦監稅使們的反抗，明陝西稅監礦使：梁永，不僅堅持不撤陝西承宣布政使司鹹陽縣、陝西都指揮使司潼關衛，兩地的稅役，且糾集無賴縱橫苛征，漁肉百姓，濫捕無辜百姓數十人，橫加拷掠，勒索民財，致使人心惶惶。
因此明陝西總鎮巡撫兼都察院右副都禦史：顧其誌，為平民憤，將首要分子明陝西稅監右少監：王遇義，等人依法治罪，讓明陝西稅監礦使大為惱恨，伺機報複。
此時其黨鹹陽縣百姓：胡奉因，與明鹹陽縣知縣：陳時濟，積有私怨，即唆使明陝西稅監礦使令取鹹陽縣絨氈一千五百件，價值計銀四千兩。
因而被明鹹陽縣知縣給拒絕，怒而不給，被明陝西稅監礦使誣告明鹹陽縣知縣抗旨劫稅，遭到明神宗下令逮捕明鹹陽縣知縣！
2月11日，由於明皇三子福親王：朱常洵，出生時即封其生母明鄭貴妃：鄭妙瑾，為皇貴妃，而對明皇長子：朱常洛，之生母明恭妃：王淑蓉，卻遲遲不依廷臣之請進封為皇貴妃。
在未立皇太子之時，此事曾引起種種猜測，鬨得滿城風雨，現在明神宗剛剛覺悟開始進封明恭妃為皇貴妃。
3月初6日，明雲南稅監礦使：楊榮，長期恣行威福，破壞祖宗製度，奏開寶井，又脅迫當地土司獻地開礦，致使邊境不安，外夷乘機用兵，犯我邊民。
被明雲南巡按：宋興祖，上疏彈劾，但明神宗卻不理，使得明雲南稅監礦使由是怙寵益橫，也讓雲南承宣布政使司各族人民無不恨之入骨，首先由騰越州人民發起暴動。