然而明兵部尚書：李化龍，手下左右侍郎等官員皆是虛銜，有些官職甚至無人充任！再加上經曆（萬曆三大征）之後國庫銀兩損失過大，且處於黨爭以及開礦時期，又沒陛下備戰旨意，加之建奴現在並未造反，故此兵部沒有任何備戰的意思！
3月16日未時，李氏朝鮮宣祖昭敬郡王河城大君：李昖，在吃糯米飯時突然被噎住，隨即薨逝，享年57歲。
他死後傳出兩道遺教，一道是囑咐李氏朝鮮世子邸下：李琿，愛護兄弟，另一道是托付李氏朝鮮領議政：柳永慶、李氏朝鮮右領議：韓應寅、李氏朝鮮國丈敦寧府事兼西平府院君：韓浚謙、李氏朝鮮義州防禦使：申欽、李氏朝鮮平安西道觀察使：樸東亮、李氏朝鮮吏曹判書：許筬、李氏朝鮮兵曹判書：徐渻，這七名重臣複原保護李氏朝鮮嫡長子永昌大君：李?，的生命安全以防不測！
4月20日，明禮部尚書兼東閣大學士：李庭機，稱“自臣受事以來，饑饉日趨嚴重，雲南承宣布政使司、兩廣之地冠敢於橫行，遼東都指揮使司建奴漸驕，皆深可憂慮！每見參劾將領之章奏，多是尅餉剝軍，沒人與士卒同甘苦，兵弱餉急，太倉庫久空，太仆寺亦空，內庫難捐，稅使難撤，部、院缺官，六科、十三道積滯，人心日以渙散，政事日以廢弛，鹽法積弊不可禁除，京商苦累莫為計議，至於工作之虛糜，官吏之貪墨，刑獄之淹抑，風俗這奢靡，民間之愁怨，天下事尚有不能儘言者。臣論義則不可當止，論力則不能當正，請賜罷歸。”
此奏折由通政使司交給明神宗：朱翊鈞，覽疏後下令優旨慰留，而對於政事則不置可否！
4月25日，明尚膳監監丞兼遼東礦監稅使：高淮，自從負責開礦之日起，便征稅遼東都指揮使司各地，其黨橫行激起民變，明遼東礦監稅使遂誣逮諸生數十人，反被明遼東巡按兼都察院右僉都禦史：熊廷弼，所彈劾，明神宗卻置之不理。
於是明遼東礦監稅使就率家丁三百餘人，聲言將入京見明神宗，潛駐在北直隸京師外城廣渠門外。
明兵科右給事中：田大益，等臣子們言“高淮搜括士民，取金至數十萬，招納諸亡命降人，意欲何為？”
就連明吏部尚書：李戴、明刑部尚書：蕭大亨，亦皆上疏彈劾稱“高淮撤離信地遼東都指揮使司，挾兵潛往京師，此為數百年來未有之事。”
包括明都察院山東道監察禦史：袁九皋，等人也分彆彈劾明遼東礦監稅使：高淮，可明神宗就是不聽！
最後明遼東巡撫：趙輯，也彈劾道“高淮罪惡萬端，且無故打死廣寧衛指揮使：張汝立。”
明神宗還是不聽。
於是明遼東礦監稅使開始反擊了，他上疏自稱鎮守有功，且協同關務，但是兵部卻奏其狂妄，不過明神宗心護他，回複道“朕固命之矣。”
從此明遼東礦監稅使自恃無恐，便進一步招募死士，時時出塞射獵，發黃票龍旗，向李氏朝鮮王國索取冠珠、貂馬，且數次與邊軍將士爭搶功勞，山海衛內外皆被其害。
其中明遼東礦監稅使還時時克扣將士月糧，手下明遼東礦監太監：廖國泰，旋誣劾暫任明遼東總鎮總兵：馬林，扣除軍士月糧俸祿。
明神宗得知後讓吏部下令免去馬林總鎮總兵一職，改為前任遼東總鎮總兵兼寧遠伯：李成梁，上任並且撤去都察院調查之事。
為此激起了廣寧前屯衛、金州衛，將士3千多人發生兵變，皆稱要食高淮之肉。
6月10日，廣寧中屯衛、鬆山堡，以及山海衛等地明軍也加入到討打高淮的陣營中，此舉讓明遼東礦監稅使大驚，他連忙逃奔入山海衛關內。
怎奈路遇山海衛叛軍無路可走，隻能由水路乘船到天津衛碼頭，在前往京師避難。
途中還上奏托人誣告明山海衛指揮同知：王邦才、明山海衛左參將：李獲陽，逐殺朝廷命官，劫奪上供錢糧，被明神宗命北鎮撫司錦衣衛提騎逮問王邦才、李獲陽，因此激起了邊民們的大嘩。
由此明薊遼總督：蹇達，立即上書揭露了明遼東礦監稅使的反間計罪狀，明神宗得知後始命高淮回京，而以明通灣稅監：張曄，兼領其事。
6月19日，年老體邁82歲米壽之年的前任明遼東總鎮總兵兼寧遠伯：李成梁，致仕正式下崗，由明薊州總鎮總兵：杜鬆，代替其職。
6月26日，李氏朝鮮光海君以權署國事的名義，派遣了李氏朝鮮禮曹參議：李好閔，等使臣趕赴大明帝國求賜封。
但大明禮部與明神宗卻堅持認為李氏朝鮮光海君的合法性不足，要派遣官員去李氏朝鮮王國調查，可李氏朝鮮禮曹參議則辯解稱；先王長子李氏朝鮮臨海君：李珒，已中風，無法繼承王位！