敵人出現在視野到登陸完畢，足足共花了三日時間。這不是敵人拖遝，而是因為其數量實在太多了。從台南堡最高處的瞭望塔望去，隻見敵人布滿了整個海灘，大小上千艘船隻也停滿了附近的海岸——除了碼頭。敵人剛開始時，也試圖從碼頭登陸，隻不過被台南堡上要塞炮一通亂揍，當場沉了十幾艘船隻，便遠遠離了堡壘。
登陸的敵人果然如同情報所說，竟然有兩萬人，這讓李杆子臉色越發陰沉起來，堡壘之中的士兵也沉默不語。夏大根護送百姓退走之時，留下的糧食和白糖裝滿了台南堡的旮旮角角。即便如此，還有不少糧食和貨物帶不走，隻得送給了友善的生番部落。台南堡中的彈藥數量也多，雖然不如糧食那麼誇張，但也裝滿了堡壘的軍火庫。
雖然糧草彈藥充足，但堡壘之中除了五百守備營士兵外，隻有五百基乾民兵。這千人兵力與外麵的敵人相比，實在是過於懸殊。並非夏大根不願意留下更多的兵力，而是台南堡隻不過三十餘畝大，要容納這麼多人已十分困難。流求氣侯炎熱，人口密度過大極易發生瘟疫，實在不能再增加兵力。
所幸的是，台南堡屬於霹靂軍的第二代堡壘。其在橫原堡的基礎上進行了優化設計，還針對炎熱的氣侯加大了通風設計，故防禦力和舒適性都增強了不少。內外堡配置的十八門重型要塞炮和三十餘門中小型火炮，形成了遠中近無死角的火力網。當得知敵人入侵消息之時，李杆子又命人在護城河前挖了幾條深壕，又將堡壘周圍兩裡地的房屋全部焚燒，以清理火炮的射界。
流求公司在組織人員撤退之時，並沒有進行堅壁清野。除了時間來不及，更重要的是在餘柱等高層看來，這隻是暫時的避敵鋒芒的戰略撤退，並不是要放棄台南。等打退了敵人，還要組織百姓回來建設家園。“一山不容二虎”，流求公司絕對不會允許將辛苦建設的產業拱手讓人，也不會容忍有其他勢力在流求島上盤踞。用夏大根安慰眼淚汪汪的百姓們的話來說：“眼下種下甘蔗苗，便有人來幫我們照料。待收割甘蔗的時候我們再回來”
夏大根的話在有心人聽來，意味深長。他是在警告敵人安插在流求的內奸，你們是誰？想乾什麼？我們都清清楚楚，最終的勝利終將屬於流求公司。事實證明，敵人在台南登陸後的一係列舉動，也看出他們並非隻知道燒殺搶掠奪的普通海匪。他們先是將台南堡層層包圍起來，又派了大軍沿著官道前去進攻台中，還有條不紊接管了屯墾點，甚至還派了人引水灌溉甘蔗田。
從圍攻台南堡的敵人來看，也異於尋常的海匪。雖然他們拿著的五花八門武器，也打著各種亂七八糟的旗幟。但從其進退秩序和營地的整齊程度來看，其組織程度並不比南宋的官軍差。更重要的，這些海匪居然像模像樣地紮下了營壘，築了壕溝、立了柵欄和瞭望塔，排兵布陣顯然出自《武經總要》。
李杆子眼見這個陣仗，知道敵人絕非烏合之眾，便絕了夜襲之心。留下圍困堡壘的敵人足足有五千人之多，即便有火器優勢，也突破不了敵人的封鎖。他打定決心以靜製動，敵人若進攻便隻能拿人命來填，即便長期圍困也不怕。隻要等已方海上援軍一到，即便守不住堡壘，也可以從容退去。