朱清命人將兩隻狀態最好的大船拖上岸進行修理，在修繕完畢後啟程返回流求。除了清除船底的藤壺，更換船蛆蛀空的木頭外，還要對船帆和船體破損部位進行修理。雖然現在已經有了成熟的海圖，沿線也配套了補給點，但回到流求海上行程有上萬裡。準備的越充分，應對就越有底氣。探險隊的其餘船隻，在經過滔天惡浪之後，已不適合長途遠航。況且新蜀州的發展和保衛，也需要大型船隻，不宜全部返回。
三個月後，返回流求的船隻啟航了。兩船除了操船的水手外，還有幾十名土著，其中還包括阿茲特克貴族和幾個部族的酋長。隨船的物資則是新大陸的各種特產，特彆農作物。隨船的金銀隻有數萬兩，隻占探險隊所獲金銀的很小一部分。事實上，特諾奇提特蘭城之戰中繳獲的黃金、白銀和寶石數量眾多，加上貿易所得的金銀，足足堆滿了新蜀州的幾間庫房。朱清之所以沒有將這些金銀運回流求，一方麵是船艙有限的容量要優先裝載食物、淡水、藥品等必須物資。另一方麵也是怕路途上不安全。
朱清沒有帶隊返回流求，而是讓人帶回了一封長信。在信中，他詳細介紹了探險隊的經曆，又向餘柱提出了四個請求。第一個請求就是派船隊來運輸金銀。這些財富實在太大，實在經不起損失。海上的風浪等意外是一方麵，也會因消息走漏引起亡命之徒的鋌而走險，進而在半途進行截殺。霹靂軍的抗蒙事業對資金需求十分大，需要儘快運回。
第二個請求是派來工匠、教師、醫生等技術人員。當下新蜀州最需要的是煉鐵和工具、武器製作的人才。隻要有了鐵製的工具，必將促進生產效率呈幾何級數增長。雖然新大陸人口因疫病的原因在下降，但其龐大的勞動力數量，將會促進各項建設的大規模開展。教師和醫生的重要性不言而喻，朱清要求至少要各派五十名。
朱清的第三個請求是派來軍隊。雖然阿茲特克帝國已經崩潰，但其周邊仍有不少野蠻部族。這些部族與阿茲特克人文化和宗教差異極大，並不會理會“神使”這一說法。“距離差生美”，隨著與探險隊員接觸的加深，不少部族也會對新蜀州的神性產生懷疑，因為他們會發現這些神使也會生老病死，也會流血。除了有發出電閃雷鳴的武器和許多奇怪的物品外，與自己並無多大差彆。
當盲目崇拜消褪之後，相互差異極大的各部族必然會出現不聽號令的情況，發生此起彼伏的內鬥，甚至會將矛頭指向新蜀州。此時有一支強悍的軍隊便必不可少，餘柱的建議是從流求派來一個團的火器部隊。在艦隊方麵，隻需十艘中型船隻即可。這些軍力加上征調的土著士兵，足以應對新大陸出現的任何威脅。
朱清提出的第四個請求則是派遣官員前來。他雖然不缺政治智慧又有幕僚協助，但畢竟出身草莽，加之不識字，並不擅長處理政務。遠征特諾奇提特蘭城，朱清做得極為得心應手，但隨之而來的善後和建設，則讓他焦頭爛額，痛苦不堪。他更喜歡帶領手下，率領船隊沿海岸進行探索。按照歐陽軒手繪的草圖來看，地峽隻是新大陸很小的一部分，資源也遠不如野牛大陸和羊駝大陸豐富。朱清的打算是待流求派來政務官員，他便可抽身前去探索，以實現如餘福那樣的成就。