韓世忠、張俊、劉光世率兵入城，行至宮門。韓世忠欲入，其部將張介道：“不可，雖聞二賊已去，尚未可知。”
此時高宗皇帝聞得諸將入城，心中歡喜，步行至宮門迎接。方一見麵，便執韓世忠之手慟哭道：“中軍吳湛佐逆為最，尚留朕肘腋，能先誅乎？”
韓世忠道：“陛下勿憂，叛臣皆誅，以正國法！”於是便召吳湛前來。吳湛不知何意，來到跟前，韓世忠見狀，不動聲色上前握住吳湛之手。吳湛正在疑惑，突然手上劇痛，隻見韓世忠一臉陰沉，喝道：“汝膽色甚好，竟敢從賊逼宮！”
吳湛聞言大驚，急忙甩手想要逃脫，但韓世忠力大，緊握其手不放。吳湛雖百般掙紮，卻是脫之不出。韓世忠心中憤恨，手上更加用力，忽聽吳湛慘叫一聲，原來中指竟被韓世忠生生捏斷。
見吳湛疼痛倒地，縮做一團。門下禁衛見狀將韓世忠團團圍住，其凜然不懼，按劍叱之，眾禁衛無敢動者。韓世忠隨即下令，將吳湛與王世修於當街斬首，號令於宮門外。
隨後呂頤浩、張浚大軍也已入城，自此苗劉兵變平息，高宗皇帝終於放下心來，回想這些時候自己每日如坐針氈，生怕某日便人頭落地之心情，不禁心中後怕。心中暗下決心，定不可使外將獨專其軍，須有心腹精銳時刻拱衛禁宮。
待得心緒稍寧，高宗皇帝詔諭封賞，追贈王淵開府儀同三司。起複定國軍承宣使、帶禦器械、鄜延路馬步軍總管、禦營平寇左將軍韓世忠為武勝軍節度使，充禦營左軍都統製。寧武軍承宣使、帶禦器械、秦鳳路馬步軍副總管、禦營前軍統製張俊為鎮西軍節度使，充禦營右軍都統製。秘閣修撰、知平江府湯東野充徽猷閣待製。朝奉大夫、知常州周杞充右文殿修撰：自餘將佐，鹹進官二等。
隨後張浚進言道：“逆臣苗傅、劉正彥引兵遁走，請行下諸州，生擒傅、正彥者，白身除觀察使，不願就者賞錢十萬緡，斬首者依此。搏獲王鈞甫、馬柔吉、張逵、苗瑀、苗翊，並轉七官。其餘官兵、將校，並與放罪，一切不問。仍降黃榜曉諭。”高宗皇帝從之。
韓世忠請戰道：“賊擁精兵，距甌、閩甚邇，儻成巢窟，卒未可滅，臣請討之。”高宗皇帝點頭許之。
臨彆之時，韓世忠問道：“臣誓生獲賊，為社稷刷恥，乞殿前二虎賁護俘來獻。”高宗皇帝大喜，命宮中兩名衛士率韓世忠一同出兵，臨行時更親自為韓世忠餞行。
隨後韓世忠領命起兵追擊苗、劉二人，下得朝堂，朱勝非又囑咐韓世忠道“請太尉速追討，毋令其過江。”韓世忠點頭稱是，而後率兵出城而去。
此時苗傅、劉正彥出杭州向南進犯富陽縣，統製官喬仲福沿途追擊，二人兵敗而退。隨後又犯桐廬縣，及至白沙渡，所過燔橋以阻官軍。之後再犯壽昌縣，黥民充軍。攻到衢州時，被守臣胡唐老擊退。
無奈之下苗劉二人轉道進犯常山縣，而後攻破玉山縣，屯兵沙溪鎮。此時統製巨師古自江東來，與喬仲福、王德會於信州。苗劉二人聞之，急起大軍屯於衢、信二州之間。
此時的苗傅與劉正彥已至山窮水儘，四處兵馬齊來征討，見其敗勢已不可免，手下將士亦有二心。其部將張翼夜斬馬柔吉父子與王鈞甫後率部出逃，降於江、浙製置使周望，周望受降後上報高宗皇帝，於是龍顏大悅。