這些疾病像藤條一樣鞭打他，午夜夢回，如魔鬼恫嚇將他驚醒。柳宗元半夜時常感到大汗淋漓、喉嚨尖痛，連走起路來，都感到恍惚。
早在貶永州時，柳宗元在《茅簷下始栽竹》詩中就提到了自己的足疾：
“瘴茅葺為宇，溽暑常侵肌。適有重膇疾，蒸鬱寧所宜。
東鄰幸導我，樹竹邀涼颸。欣然愜吾誌，荷鍤西岩垂。
楚壤多怪石，墾鑿力已疲。江風忽雲暮，輿曳還相追。
蕭瑟過極浦，旖旎附幽墀。貞根期永固，貽爾寒泉滋。
夜窗遂不掩，羽扇寧複持。清泠集濃露，枕簟淒已知。
網蟲依密葉，曉禽棲迥枝。豈伊紛囂間，重以心慮怡。
嘉爾亭亭質，自遠棄幽期。不見野蔓草，蓊蔚有華姿。
諒無淩寒色，豈與青山辭。”
元和三年（808年）在永州寫下這首詩的十一年後，元和十四年（819年）十一月八日，柳宗元卒於柳州，享年四十七歲。
柳宗元為官清廉，柳州又是荒涼之州，所以他死後家境很是淒涼，留下二子二女。長子周六僅六歲，次子周七是遺腹子，長女年齡大些，但也未成人。
裴行立為孤兒寡婦籌措了費用，由柳宗元的表弟盧遵經辦喪事，並把靈柩運回長安萬年縣，歸葬於先墓。
在柳州，作為一個地方官，柳宗元鞠躬儘瘁，用自己畢生的才華和心血，為當地人民鋪築了一條通往文明社會的大道。從個人的角度而言，柳宗元在柳州的四年是他**生涯中令人歎息的結尾，但作為柳州曆史上名垂青史的好官，他付出的精力和做出的貢獻，卻是令人懷念，不能遺忘的。
柳州百姓並未忘記這位才華橫溢又無端遭貶的天才詩人，更未忘記他在困頓之中仍為柳州人民興利除弊、遺惠一方的德政。柳宗元逝世後，柳州人民在城東南的羅池畔修建了一座柳侯祠，並且在祠後建了衣冠塚，以享四時香煙。