四等人製度到底存不存在的爭論，其實歸根結底就是歧視上，其實主觀上講這應該是沒有的，至少在最初是沒那麼強烈的。熟悉草原遊牧同胞們生活習慣的人就會知道，他們生活簡樸，想法也簡單。
對自己的財產大抵會說有多少隻羊、多少頭牛或者多少匹馬，羊麼今年生的小羊羔多少隻，去年留下來的有多少隻等等。做生意也嫌一頭一頭數牛羊太麻煩，直接是這一群有多少隻，什麼價位，不要懷疑，就是這麼簡單粗暴。就好比沒有糧倉會給你按斤售賣糧食一樣，咱都上噸，這種計量方法在商業往來上或許弊端不大，但是用在治國之上，就要老命了。
對於外人他們是佩服有真本事的人的，例如射雕英雄傳裡麵的郭靖和丘處機，這都是有大本事的人，因此當時在草原被待為上賓（雖然是小說情節，但卻是現實，有機會歡迎大家親身體驗一下來自草原同胞的熱情）。
元史上講，蒙古人作為統治民族列為第一等級，其他根據所征服地區民族的時序，又依次分為色目人、漢人、南人三個等級（注意，這個等級分類不是以民族、信仰、身份、文化等分的，是以被征服的先後順序，這也是我說四等人製度主觀上是不存在歧視的原因，大概率是習慣使然）。
這個四等人製度最初隻是為了便於對統治區域內的人進行管理，從情理上來說，四等人製度在元初是可以理解的，但是治國要依法治，情理治國，變數太大，畢竟人的好惡不同，到後麵就會慢慢變味，以至於客觀上存在了歧視。
兩製並行和行省製度
考慮到蒙古人數量問題，大元朝采用的是內蒙（草原製度）外漢（中原製度）兩種製度。
忽必烈沒建立大元的時候，就崇尚中原王朝的政治、經濟、文化製度，大元建立之後，忽必烈接受劉秉忠等人的建議，基本沿襲了金、宋舊製，也對蒙古舊製進行了改造，下令敕造太廟（但依然堅持老傳統秘葬）。
在朝堂上設置了中書省行使宰相之權，樞密院統領全國軍隊，禦史台監察天下，宣政院管理全國宗教及吐蕃地區軍政，在地方實行行省（這也是現在行省製度的初始形態）和路、府、州、縣製，把全國分成了十個行省和兩個特彆行政區：遼陽行省：包括遼寧，吉林，黑龍江以及黑龍江以北、烏蘇裡江以東地區，省治遼陽；河南江北行省：包括河南、湖北、安徽、江蘇省長江以北地區，省治汴梁（開封）；陝西行省：包括陝西省以及內蒙古、甘肅部分地區，省治京兆（西安）；四川行省：包括甘肅省、寧夏以及內蒙古部分地區，省治成都（成都的名字可以追溯到很久之前）；甘肅行省：包括甘肅省、寧夏以及內蒙古部分地區，省治甘州（張掖）；雲南行省：包括雲南全境以及四川、廣西部分地區；泰國、緬北部分地區，省治慶中（昆明）；江浙行省：包括浙江、福建兩省和江蘇南部地區，以及江西部分地區，省治杭州；江西行省：包括江西省大部和廣東省，省治龍興（南昌）；湖廣行省：包括湖南、貴州、廣西三省大部以及湖北省南部地區，省治鄂州（武漢）；嶺北行省：包括中國內蒙古、新疆部分地區以及俄羅斯西伯利亞地區以及蒙古國全境，省治和林（改稱和寧，現屬於蒙古國）；中書省直轄（腹裡）：包括河北、山東、山西三省，內蒙古大部分地區；此外總管全國佛教事務的宣政院，直轄西藏以及四川、青海部分地區。
雖然管理機構設置上承襲了宋金和創新，但是在元朝官方機構中大蒙古國的官職也被保留了下來，而且分布於每一級官方機構之中，且具有絕對領導地位。比如行省作為大元朝最高行政機構，設丞相一人，蒙古人擔任，在路府州縣蒙古人必須任達魯花赤（行政長官），色目人任同知，其他的低級官員才可以由其他漢人、南人擔任，這就造成在中央核心機構蒙古人占絕對多數，而在地方又是其他族人占大多數，有點頭重腳輕的意思。
在這種二元製度下，大元朝黃金家族掌握著國家的最高權力，其他蒙古貴族控製在國家的中樞，負責製定國家政策，蒙古人在大元朝享有許多特殊待遇不納稅、不服徭役、當高官（元朝廢除了科舉製度，這個後麵講），而漢人、南人卻處於被壓迫的地位，為了維護蒙古人的特殊地位，忽必烈還下令實行分居製和禁止通婚製度，這都為後麵國家矛盾激化埋下了禍根。