次日10月初5日，幕府從四位下侍從兼豐後國小倉城主：細川忠興，再次率領倭軍兵臨尚慶右道晉州牧城下。
當得知城中隻有三千多名李氏朝鮮守軍的時候，讓幕府從四位下侍從非常高興，他認為又將是一次輕而易舉的勝利？
可就在倭軍們架起梯子攻城時，李氏朝鮮軍隊卻使用大炮、弓箭、火繩槍，對準攻城的倭軍發起猛烈射擊，使得倭軍傷亡慘重，也讓幕府從四位下侍從甚為震驚，他連忙下令鐵炮隊使用火繩槍的火力，用來掩護本部軍隊攻城。
但守城的李氏朝鮮軍卻冒著彈雨，使用石塊和斧頭摧毀了攻城梯，待攻城梯被摧毀後，李氏朝鮮軍又在城樓上，使用火繩槍居高臨下地對倭軍發起射擊，導致倭軍的傷亡更加慘重。
雙方在持續戰鬥了第三天後，李氏朝鮮晉州牧使：金時敏，被鉛彈擊中頭部，傷重無法繼續指揮戰鬥！
這被幕府從四位下侍從探知後，便又發起了更為猛烈的攻城，還試圖借此機會摧毀李氏朝鮮守軍們的鬥誌，雖然李氏朝鮮守軍們堅持奮戰，但卻沒有統一的領導，處於非常不利的地位。
此時李氏朝鮮義軍統領：郭再祐，得知倭軍攻打晉州牧之事，他立即率領二千餘人的義軍馳赴晉州牧，並發起遊擊戰，趁夜偷襲了倭軍營地。
郭再祐身穿紅色緋緞所織成的戰袍，率義軍迅速闖入倭軍營地內，突襲毫無防備的倭軍士兵，並故意發出巨大聲響以製造恐慌，隨後便消失地無影無蹤。
因此倭軍對郭再祐都十分畏懼，稱他為「天降紅衣將軍」。
經過這次襲擊之後幕府從四位下侍從，也意識到如此下去幕府軍隊必然損失慘重，隻得下令撤退，才讓李氏朝鮮軍隊成功守住了晉州牧。
此次的晉州牧大捷與閒山島大捷、幸州城大捷，並稱為；李氏朝鮮王國在壬辰衛國戰爭中的三大捷，而晉州牧大捷的勝利，也相繼傳到李氏朝鮮八道各地，很大程度上鼓舞了李氏朝鮮軍隊原本低落的士氣。
10月25日，在大明帝國的東北方建州左衛軍民指揮所裡麵誕生了一位對手，那就是明建州左衛軍民指揮使：愛新覺羅·努爾哈赤，側福晉：納拉·孟古哲哲，所生的兒子，明建州左衛軍民指揮使的第八子：愛新覺羅·紅歹是（女真文：黃台吉）。
同時李氏朝鮮全羅左道水軍節度使兼三道水軍統製使：李舜臣，仍兼本職，負責指揮全羅左右道、忠清左右道、尚慶左右道，這三道的水師軍隊。
其麾下擁有；110艘戰船、110艘斥候船、士兵17000餘人，專門負責打擊沿海地區倭軍，但恰逢大明與幕府和談期間，因此李氏朝鮮全羅左道水軍節度使兼三道水軍統製使就顯得有些多餘了，無用武之地！
而此時，一意主和的明遼東經略：宋應昌，卻發覺倭方尚未準備好幕府關白：豐臣秀吉，的投降書？
於是明遼東經略就命明禦倭遊擊將軍：沈惟敬，第四次複入倭營促謝表，明禦倭遊擊將軍於同年12月初7日，再入幕府第一軍左副將：小西行長，的軍營中展開和談。
明萬曆二十二年公元1594年正月初3日，幕府第一軍左副將：小西行長、幕府：小西飛與明禦倭遊擊將軍：沈惟敬，等人終於偽造了一封幕府關白：豐臣秀吉，的《關白降表》。
不過當時關於幕府關白提出的議和條件書，卻沒有報告給大明朝廷，僅僅隻是圍繞在大明內部群臣們商議要不要與幕府議和之事？而展開了激烈的爭論。
正月20日，明神宗：朱翊鈞，下詔說道“去年各大布政司災傷，以；山東承宣布政使司、河南承宣布政使司，以及南直隸徐州、淮安府，等處尤為嚴重！朕屢次下令救濟，不知有司是曾否奉行？百姓是否得到實惠？值此公私交困之時，不知各地除了動用國庫錢糧之外，是否有急救便宜措施？各地鬨事的礦徒是否已經安置歸農？今日四方吏治，全不講求荒政，牧養小民，惟以搏擊風力為名聲，交際趨承為職業，費用侈於公庭，追呼偏於閭裡，囂論者不能禁止，流亡者不能招徠，遇有盜賊，則互相隱匿，或故意徇私，以求免地方失事之咎，而各地巡撫、巡按官亦止知請振請蠲，不能汰一苛吏，革一弊法，如此上下相蒙，釀成盜賊之患，朕甚憂之，自今當以安民弭盜為有司之黜陟，如有仍前欺隱及玩視詔令者，當重治不宥。”
2月12日，明吏部文選清吏司郎中：顧憲成，先因反對三皇子並封王之事而觸犯了明神宗，後又在一年一度的「京察」中因支持明吏部尚書：孫瓏，而得罪了明內閣首輔：王錫爵。
恰逢王閣老致仕（辭官）群臣們開始會推閣臣，先前由明吏部文選清吏司郎中：顧憲成，推舉明東閣大學士：王家屏，明神宗棄而不用。