明軍用城頭的火炮轟擊遠處的敵人，還用火罐矢石攻擊城下的敵兵，並用長矛大刀刺砍爬上雲梯的敵軍，戰況十分激烈！
經過兩天兩夜激烈的戰鬥，後金陣亡超過4千餘人，但依舊猛攻黃總鎮總兵組織的明軍三次出城反擊，雖然暫時將後金軍擊退，但後金軍很快就再次卷土重來，圍城攻打不輟。
7月初7日，新任尼德蘭王國（荷蘭）荷屬東印度公司駐台灣府總督：普特曼斯，率領以密德堡號為旗艦的13艘荷蘭戰艦，以突然襲擊的方式對大明帝國廣東承宣布政使司潮州府、福建承宣布政使司漳州府交界的南澳島，發起了進攻。
南澳島守軍們立即給予還擊，在激戰中明南澳島把總：範汝耀，身受重傷，17名明軍將士陣亡，而尼德蘭軍隊也有部分傷亡，不得不解圍北上。
7月11日，尼德蘭軍船隊Wieringer號，在東南沿海掠劫途中與26艘明軍戰船相遇，雙方展開水戰開火，尼德蘭水師敗下隻能丟失物資撤退。
7月12日，尼德蘭軍船隊開到了福建都指揮使司中左守禦千戶所（廈門）海域上，當時中左守禦千戶所港口內，正停泊著幾十艘明明待修船隻。
此時南澳島戰鬥的消息尚未傳來，因此明中左守禦千戶：張永產，正在泉州府操辦器械，明延平衛遊擊將軍：鄭芝龍，也正率領主力部隊在福寧州剿匪。
因此尼德蘭軍船隊Tessel號、Weesp號、Couckebacker號、Catwijck號、Kemphaen號，相繼對中左守禦千戶所港口內的明軍戰艦發動突襲。
瞬間擊沉了25~30艘大型戰船，以及15~20艘小型戰船，暗自竊喜離去。
戌時，中左守禦千戶所商人跑到尼德蘭軍船隊上詢問攻擊理由？但尼德蘭人並沒有做任何解釋，反而驅趕大明商人，還繼續派遣Kemphaen號、Zeeburch號、Salm號，以及一艘大明海盜帆船又來到中左守禦千戶所北部進行掠劫。
這次尼德蘭人除了到處搶奪食物外，還迫使中左守禦千戶所、金門守禦千戶所、烈嶼、鼓浪嶼，以及附近村落每周必須提供25隻豬、100隻雞、25頭牛，否則就再度燒殺搶掠。
但是大明地方衙門依舊處於毫無戒備的狀態！
結果尼德蘭人肆無忌憚，一舉燒毀和擊沉了大明方麵的15艘戰船（鄭軍10艘，明廷5艘），並登岸大掠。
待偷襲得手後，尼德蘭人還封鎖了中左守禦千戶所灣，並威脅地方衛所開放貿易。
7月14日，明延平衛遊擊將軍就派遣使者對尼德蘭船隊送交信件，要求釋放7月12日扣留的大明商人，並解釋為何尼德蘭軍船隊，要前來我大明中左守禦千戶所攻擊的原因？
尼德蘭人則單方麵釋放了大明商人，還解釋說是貿易矛盾。
此時大明金州衛方麵經過幾天的激戰，明軍的火藥和弓箭消耗殆儘，金州衛城門被後金都元帥與後金水師總兵攻克，黃總鎮總兵隻得退到金州中左守禦千戶所繼續抵抗。
意識到了形勢危急，明東江總鎮總兵立即找來明金州衛千戶：譚應華，說道“敵眾我寡，今夕城必破，若速持吾印送登州府，不能赴，即投諸海可也。”
隨後明軍繼續抵抗，先後殺死後金一等信勇公：瓜爾佳·費英東，之子後金正黃旗牛錄額真：瓜爾佳·納海、後金正紅旗甲喇額真：扈什哈理·嶽樂順、後金巴牙喇壯達：額德、後金複州衛千總：程國輔、後金鑲紅旗牛錄額真：西克特立·塔納喀。
由於後金方麵久攻不下損兵折將，後金都元帥與後金水師總兵就繞到後方，從蔡家口一帶上岸攻入金州中左守禦千戶所城內，明軍拚死阻擊，但終因寡不敵眾，被後金軍成功攻入金州中左守禦千戶所城內。
關鍵時刻明東江總鎮總兵：黃龍，身披直身甲頭戴萬曆盔，帶領守軍與敵人進行巷戰，明金州衛遊擊將軍：李惟鸞、明長生島左參將：項祚臨、明南關遊擊將軍：樊化龍、明麻洋島千總：張大祿、明皮島遊擊將軍：尚可進（尚可喜哥）、明金州衛試百戶：尚可義，(尚可喜弟)等將領出擊。
最終明東江總鎮總兵眼見眾將一個個倒下，他不願意被俘受辱，便拔刀自刎，至此金州衛與金州中左守禦千戶所陷落。