中華總商會的這一係列行為，也引發了江南鹽商會以及徽、晉、陝、魯、閩、粵、寧波、洞庭、江右、龍遊等十餘家大型商會的聯手抵製。
就在各地商會與當地官府勾結，準備對中華總商會采取反製措施的時候，各地的官府衙門、功勳貴族、達官顯要們，卻紛紛遭到錦衣衛和東廠廠公的聯合“拜訪”。
明確言明中華總商會，乃是大明國內唯一一家，經過朝廷中樞備案並依法納稅的合法組織，朝廷下轄的各個官府衙門都必須予以保護。
各地商會和官員們在麵對利益流失時，並沒有向錦衣衛和東廠廠公屈服。紛紛通過他們在北京朝廷中的代言人，竟然公然在奉天殿舉行的大朝會上，集體向崇禎皇帝提出了控訴。
然而這一次，崇禎皇帝卻一反常態，沒有像以往那樣采取懷柔策略，而是直接在大朝會上拍案而起。
將那些公然跳出來反對，以及質疑中華總商會的臣工們，處以罰俸半年的處罰，並逐一實施廷杖之刑。
崇禎皇帝怒斥這些臣工渾身散發著銅臭味，竟然將商人的市井伎倆，公然當作國家大事在朝會上討論，實在是讓人無法容忍。
與此同時，少數幾位支持中華總商會，倡導規範大明國商業環境，鼓勵商人依法繳納商稅，積極穩定民間物價的官員。
雖然在大朝會上也受到了責備，但並未遭受到任何實質性的懲處。這無疑就表明了崇禎對待此事的鮮明立場。
緊隨其後的便是錦衣衛北鎮撫司，迅速派出了大量錦衣衛，前往那些遭受廷杖的官員家中了解情況。
向那些跳出來反對中華總商會的官員們，十分鄭重的傳達了崇禎的口諭：
“朕，對官商勾結的惡劣行徑深惡痛絕！
爾等若是再敢提及此事，錦衣衛就會派出偵騎查辦貪腐。”
由於崇禎皇帝的強硬態度，這場原本發生在商人之間的爭執糾紛，剛剛露出些許苗頭，便被毫不留情的扼殺於萌芽狀態。
那些嗅覺敏銳、消息靈通的商人們，紛紛想方設法通過各種渠道，去打探中華總商會的背景靠山，但結果卻都是一無所獲。
他們僅僅知道，在中華總商會的背後，有一股極為強大的力量作為支撐，但具體是何方神聖在給予支持，卻是眾說紛紜，沒有一個確切的答案。
人們所能聯想到的，無非就是大明朝廷中的那些功臣勳貴，或者是某位不安分的朱姓王爺，然而，卻沒有人將中華總商會與皇室聯係起來。
畢竟，自從明太祖朱元璋起，對於商人追逐利益的行為，一直持鄙夷態度，曆代皇帝更是采取了極其嚴厲的打壓政策。
商人的地位在士、農、工、商中處於四民之末，甚至比人數眾多的農戶還要低賤。
而且，商人的權力還遭受到各種限製，比如禁止參加科舉、禁止被舉薦入仕、禁止穿絲綢錦緞、禁止騎馬招搖過市。
在知道中華總商會根基深厚，很可能會一枝獨秀後，大明國各地的商人就都湧向了南京城，希望能早日享受到中華總商會帶來的營商便利。
然而，當他們來到中華總商會門口，看到張貼出來的各項規章製度時，心中又湧起了難以接受的抵觸情緒，仿佛被一盆冷水當頭潑下。
中華總商會規定所有入會的商人，每年必須按時、足額的向朝廷繳納各種稅款。