隨後，眾人儘可能快的進行了趕路，同時在一處分岔路口，蓮太郎果斷的選擇了所有人一起前往巨石碑所在的方向，而不是他們繼續前行的方向。最終趕到了一麵寬度一米左右的牆壁處，在翠，弓月以及火垂三名起始者解放自己的能力，通過超過常人的感知和觀察能力，儘快找到了一個似乎是鑰匙孔的洞，而彰磨在這時拿出了他從重傷的劍尾魚身上搜到的一把楓葉形的鑰匙，很快便打開了這麵牆壁。
而在打開這麵牆壁後，出現在眾人麵前的是一輛輕軌電車。沒有多做猶豫，眾人正好搭乘著這輛電車，成功地甩開了後麵的民警和警察們。而在下車地點，出現在他們麵前的是名為“第三生化學研究所”的一處地下研究所，經過蓮太郎的略微估算，他們現在所處的位置已經遠離了巨石碑磁場的覆蓋範圍，也就是“未探查領域”。
在打開外麵那扇顯露生鏽顏色的門以後，眾人先後進入了這研究室裡麵。裡麵很暗，感覺像是熄燈後的醫院一樣，從地板還是四周的乾淨程度來看，不久前還剛剛有人收拾過的樣子，但是，現在卻除了機械運轉的聲音，沒有了任何的人影。而在來到一間更衣室的時候，通過置物櫃上掛著的缺勤的牌子所有的都翻了過來，可以看出應該所有人都已經離開了，有不小的可能是敵人已經放棄了這個地方。
而在那之後，在來到了這件設施的地下二層以後，眾人一路前行來到了處於最深處的殺菌室。在先後通過了殺菌室的兩麵隔牆後，出現在眼前的是一條巨大的走廊，而在兩側的則是嵌在走廊邊牆中的牢籠。在蓮太郎十分緊張的打開手電筒對準其中的一間長方形牢籠時，當手電筒照到牢籠中的鮮紅的眼珠時，頓時從牢籠中傳來了震耳欲聾的狂吠，同時那隻被照到的生物瘋狂的對牢籠發起了撞擊，之後又發出喀哩喀哩的聲音死命地啃咬起牢籠邊緣，驚慌的火垂立刻就要伸手拿起突擊步槍進行射擊，而一旁的逍遙見狀及時的伸手製止了火垂。
而在蓮太郎將手電筒的光移開，眾人慢慢遠去後，那讓人心生恐慌的聲音也漸漸的消失了，仿佛什麼都沒有發生一般。為了略微緩解一下眾人因為剛剛看到那猛然衝撞牢籠的怪異生物而暫未平靜的心情，逍遙提議道：
“這裡應該都是類似的生物了吧，我們還是繼續往前看看吧，說不定就能了解到這些生物到底是什麼了。”
眾人輕輕地點了點頭，繼續探查下去極有可能引起這些生物的集體激動起來，到時候會引發什麼意外就不好說了。這段走廊，在眾人不知不覺加快的腳步當中快速走過，而在走過這個走廊輕輕地關上門以後，蓮太郎這才開始重新提及剛剛自己的所發現的東西。
“剛剛如果我沒看錯的話，那似乎是錵製的牢籠。”
“確實是錵製的，用錵製的牢籠來關原腸動物，這座研究室到底是想做什麼？”
絕大部分原腸動物都厭惡錵，用錵製牢籠來關原腸動物的話會導致原腸動物衰弱而死，對於這種做法，實在讓人難以理解，帶著這樣的疑惑，眾人繼續向裡麵走去。緊接著，眾人進入到了名為“培養室”的地方。
蓮太郎在操控著控製麵板，打開了一麵隔牆之後，水分飽滿的黃綠色球狀膨脹，如同胎動般一晃一晃的出現在了眾人的視野當中，每個袋子中布滿毛細血管，密密麻麻的從天花板垂下，大概可以裝下一個人那麼大，半透明的袋子裡培養著各式各樣的生物，因為這一袋袋的黃綠色物體從天花板上垂掛下來的樣子很像是長在藤架上葡萄一樣，讓蓮太郎逍遙以及火垂很快回想起了駿見醫師的話，“一定要燒了葡萄園才行。”
“竟然培養原腸動物，這些人已經瘋了麼？不對，似乎還不止培養原腸動物那麼簡單。”
看到這一幕場景，火冒三丈的蓮太郎聯想到之前看到的關在錵製牢籠中的原腸動物中，一個更加可怕的猜想出現在了來蓮太郎的腦海裡。
“在這裡培養的原腸動物成熟後，將其關在剛才的牢籠中，從而培養其抗錵的能力。這大概就是所謂的“黑天鵝計劃”吧。人們基於過去的常識進行預測，不會預料到的擁有錵抵抗性的原腸動物，如果大量的出現，那麼會造成的影響，或許是毀滅性的吧！再加上之前的那種有催眠性的藥物，催眠了這些擁有錵抗性的原腸動物以此達成他們的目的。”
結合之前調查的結果，蓮太郎大概地說出了這些敵人的計劃，隨後在一旁火垂與逍遙的補充下，蓮太郎大致的理清了整件事情的思路：
“之前給原腸動物做記號，應該也是進行實驗這種事情吧，將原腸動物催眠讓其進入東京區，或者直接讓它們形成進入東京區域的條件反射，就像訓練士兵時那樣。不過，在這實驗與回收原腸動物的過程中發生了一個意外，那就是被水原先生和駿見醫師發現了印有五芒星標記的原腸動物屍體，而且還因此展開了調查。而他們應該也是因為調查出了不少的秘密，所以才被滅口的吧。”
水原，你當時沒能傳達的事情就是這些麼？看著水原竟然為了這些事關人類生存的事情而努力調查，蓮太郎心裡一時間五味雜陳。而在這時候，火垂突然跪倒在地，以手掩麵：
“鬼八先生竟然為了這種事情。。。隻要有鬼八先生陪伴在身邊，我就覺得很幸福了，結果卻是——！！”
而在一旁的其他人，對於水原先生與駿見醫師的所作所為，也儘可能的表示了自己最大的敬意。同時，看著這“葡萄園”，陷入了短暫的沉默當中。