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“新一，你以後可千萬不要再玩得這麼刺激了。”
剛走出警局，阿笠博士便擦擦額頭冒出的冷汗，心有餘悸地叮囑江戶川柯南。
名為江戶川柯南，卻被阿笠博士稱為新一的男孩點點頭，同樣神情凝重。
關於他的兩樁失蹤案終於都得以解決。
人不能踏進同一條河流兩次，但是可以同時失蹤兩次。工藤新一想到這點，慶幸之餘又覺荒謬好笑。
世界對他的惡意已經遠遠超出了尋常人類的認知範圍。
這可不是他自大狂。無論向誰完整訴說他這三日來的經曆，恐怕都沒有人會相信。好吧，博士信了。
如果他不是當事人，也許還會幫忙推薦一下神經科的可靠醫生。
多羅碧加，一切不合常理之事的起點。
自從他和青梅竹馬的毛利蘭一起在遊樂園度過了相對美好的一天，周圍的所有事件都開始急轉直下，向工藤新一生動地展示了世界的神展開。
目擊神秘黑衣人的罪惡交易現場，被銀發殺手打暈後灌下不明藥物，身體在劇痛中縮小……縮小，字麵意義。
是的，工藤新一淪為了某種藥物的小白鼠，從十七歲回到了七歲。
同時意味著，他也從十七歲的高中生，成為了隻有七歲的小學生。
為了避免黑衣組織得知他幸存的真相，工藤新一不得不暫時放棄原本的身份。又因孤立無援，迫不得已向鄰居阿笠博士求助，製造虛假身份，作為江戶川柯南繼續活動。
直到未來某天，他能夠揭露黑衣組織的秘密，將他們徹底擊垮。
然而擺在他麵前的第一道難關，就是兩樁失蹤案。
江戶川柯南，失蹤。工藤新一，失蹤。
甚至立案的時候江戶川柯南這個胡編亂造的名字還不存在。
頭疼。他就是工藤新一本人，但是非但不能主動證明這一點，還要幫著隱瞞真相。
他也是江戶川柯南，如果不能順利解決失蹤案，警方不會放棄調查，隨時會有身份暴露的危險。
兩者都是他，他該如何以其中一個身份證明另一個身份的存在？
本來的他和現在的他。本我和自我，再往下就是弗洛伊德的領域了。
不是現在，真相不能在此時暴露在陽光下。走投無路又彆無他法，隻能聽取阿笠博士的建議請求外援。
他自己作為江戶川柯南現身，第一樁失蹤案便不攻自破。再請他人假扮為工藤新一現身，第二樁失蹤案也便迎刃而解。
問題在於虛假的工藤新一注定不可能長期存在，所以隻能讓他離開日本，遠離故事發生的舞台。理由很好處理，旅遊、求學、就醫……
但是有一個最大的難關。
蘭。
該如何向她解釋自己突然的不辭而彆呢？明明說好去去就回，結果轉眼就毫無預兆地直飛國外，並且短期內沒有歸期。
怎樣的謊言才能在不傷害到她的前提下解決矛盾呢？
答案是沒有。
他看著毛利蘭砸在地上的眼淚，感到無法言表的掙紮與痛苦。
他從來沒有想過要違背約定離她而去，也沒有想過平白無故消失失蹤，更不希望讓她擔驚受怕。
他無法告訴她。他不能告訴她。
真相過於沉重，他一人背負便好。
繼續以江戶川柯南的身份寄住在阿笠博士家中，辦理帝丹小學的一年級轉學申請，表麵上照常生活，在暗中調查組織……